探究由病理性事件導(dǎo)致的表型變化，通常通過測(cè)定細(xì)胞中mRNA得到基因表達(dá)譜。相比之下煞肾，使用質(zhì)譜等技術(shù)在蛋白質(zhì)組范圍內(nèi)測(cè)量蛋白質(zhì)表達(dá)的技術(shù)還存在一些問題，如只覆蓋了部分蛋白質(zhì)嗓袱，需要大量的組織籍救，并且無法直接捕獲蛋白質(zhì)活性等。為了解決這個(gè)問題渠抹，該作者開發(fā)了一個(gè)根據(jù)基因表達(dá)推斷蛋白表達(dá)的方法——VIPER蝙昙，通過對(duì)富集的調(diào)節(jié)子（Regulon）分析對(duì)蛋白質(zhì)活性進(jìn)行虛擬推斷，可以根據(jù)基因表達(dá)數(shù)據(jù)梧却，在單個(gè)樣本的基礎(chǔ)上對(duì)蛋白質(zhì)活性進(jìn)行計(jì)算推斷奇颠。它使用給定蛋白質(zhì)最直接受到調(diào)節(jié)的基因表達(dá)，例如
轉(zhuǎn)錄因子（TF）放航，作為其活性的依據(jù)烈拒。
文章原文：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5902599/
代碼實(shí)現(xiàn)：metaVIPER is implemented in viper function from Bioconductor R-package VIPER: https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/viper.html.
