LD連鎖不平衡和PI的概念問題在此不再敘述，很多文章說明這些問題硼身。
在此硅急，我想說一下，LD曲線和核苷酸多樣性的圖的問題佳遂。
一般來說营袜，LD連鎖程度越高，表明兩個SNP之間的相似度越高丑罪，那么荚板，對于PI值來說，SNP的多樣性就降低了吩屹。所以跪另，LD曲線下降越快，PI值就會越高（如上圖煤搜；引自碩士畢業(yè)論文）免绿。
LD衰減曲線在0-50k范圍內(nèi)與pi的趨勢相同，當(dāng)時后面紅色的曲線出現(xiàn)差異宅楞，我覺得是這個品種的特點(diǎn)導(dǎo)致的针姿，沒必要深究袱吆；
當(dāng)然，有一種原因是：計算的時候沒有去除雜合的個體距淫。群體中有些個體出現(xiàn)問題了绞绒，比如，群體中有些個體比較雜榕暇；有些個體不屬于該品種而被放到一起蓬衡，導(dǎo)致PI增高而LD衰減不明顯。
