零基礎(chǔ)學(xué)習(xí)R語(yǔ)言Day3
邏輯
Linux環(huán)境下的軟件安裝.png
1.Linux的"應(yīng)用商店"——Conda
2.給個(gè)人服務(wù)器下載Conda/miniconda（這里介紹miniconda）
2.1 進(jìn)入清華miniconda鏡像
2.2 確定服務(wù)器多少位: 在XShell內(nèi)輸入 uname -a
image.png
2.3 選擇對(duì)應(yīng)的版本宠纯，確定其網(wǎng)址纺非，如https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Windows-x86_64.exe 或 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
然后在XShell內(nèi)輸入 wget 網(wǎng)址 （wget: “World Wide Web” 與“get”）
image.png
3.安裝和配制miniconda
3.1 安裝: bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
過(guò)程中多個(gè)yes和enter, 直至出現(xiàn)
image.png
3.2 激活：source ~/.bashrc
3.3 添加鏡像：
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
4.入門(mén)miniconda
#4.1 當(dāng)前服務(wù)器安裝的軟件列表
conda list
#4.2 安裝軟件 ,下面的fastqc 是可變的
conda install fastqc -y
#4.3 確認(rèn)軟件是否安裝成功
fastqc --help
#4.4 下載軟件
conda remove fastqc -y
Stay foolish
