基因(Gene): 指產(chǎn)生一條有功能的蛋白質(zhì)或RNA所需的全部核苷酸序列。
編碼區(qū)CDS(coding sequence):是指編碼一段蛋白產(chǎn)物的序列智什,是與蛋白質(zhì)密碼子一一對應(yīng)的DNA序列动漾。
開放閱讀框(Open reading frame):是指從一個(gè)起始密碼子開始到一個(gè)終止密碼子結(jié)束的一段序列。
※ CDS與ORF的聯(lián)系與區(qū)別:
并不是所有讀碼框都能表達(dá)出蛋白產(chǎn)物荠锭,或者能表達(dá)出占有優(yōu)勢或者能產(chǎn)生生物學(xué)功能的蛋白旱眯;CDS必定是一個(gè)ORF,但也可能包括多個(gè)ORF证九,相反删豺,每個(gè)ORF不一定都是CDS。
ORF: -- translation(理論上存在的)愧怜, CDS: -- transcription(事實(shí)存在的)
啟動(dòng)子(Promoter)和終止子(Terminator):
啟動(dòng)子和終止子都是一段特殊的DNA序列呀页,屬于基因的非編碼區(qū),分別位于編碼區(qū)的上游和下游拥坛,負(fù)責(zé)調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄蓬蝶。
啟動(dòng)子 Promoter:
※ DNA分子上能與RNA聚合酶結(jié)合并形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體的區(qū)域。
終止子 Terminator:
※ 轉(zhuǎn)錄過程中能能夠終止RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄的DNA序列猜惋。
起始密碼子(Start codon)和終止密碼子(Stop codon) :
起始密碼子和終止密碼子都是mRNA上三聯(lián)體堿基序列丸氛,分別決定翻譯的起始和終止。
起始密碼子Start codon:
? 指mRNA上開始合成蛋白質(zhì)的密碼子著摔,也是第一個(gè)被核糖體翻譯的mRNA上的密碼子雪位,位于編碼區(qū)內(nèi),緊鄰5'非翻譯區(qū)梨撞。
終止密碼子Stop codon:
? 終止肽鏈合成的mRNA的三聯(lián)體堿基序列(UAA雹洗、UAG、UGA)卧波,它們不編碼蛋白質(zhì)时肿。
UTR(Untranslated Regions):轉(zhuǎn)錄非翻譯區(qū),是mRNA分子兩端的非編碼片段港粱。
5'-UTR從mRNA起點(diǎn)的甲基化鳥嘌呤核苷酸帽延伸至起始密碼子AUG
3'-UTR從編碼區(qū)末端的終止密碼子延伸至多聚A尾巴(Poly-A)的前端螃成。