分開與合在一起都可以分析，但目的不同。
分開分析更多強(qiáng)調(diào)看通路是被激活還是被抑制；
合在一起分析更宏觀。
1 為什么要分開討論枪萄？因?yàn)槲覀兿Ｍㄟ^看顯著上調(diào)或下調(diào)的基因中通過GO和KEGG注釋，歸類之后有沒有你所關(guān)注的科學(xué)問題
2 基因不是單獨(dú)作用的猫妙，所以你可能會發(fā)現(xiàn)希望上調(diào)的結(jié)果下調(diào)了瓷翻，希望下調(diào)的結(jié)果上調(diào)了，這個就需要你做PPI的相互作用網(wǎng)絡(luò)分析了
3 以上是基本層次的割坠，目前比較好的是做到IPA（ingenuity pathway analysis）主要對醫(yī)學(xué)和動物模型（大小鼠）相關(guān)研究有用齐帚，對上下調(diào)的基因數(shù)據(jù)做一個完整的整合分析
待續(xù)。彼哼。对妄。
