Python統(tǒng)計(jì)分析-卡方校驗(yàn)

卡方校驗(yàn)

卡方檢驗(yàn)屬于非參數(shù)檢驗(yàn)的范疇吆玖,用于統(tǒng)計(jì)樣本的實(shí)際觀測值與理論推斷值之間的偏離程度咖气,實(shí)際觀測值與理論推斷值之間的偏離程度就決定卡方值的大小见秽。如果卡方值越大锣夹,二者偏差程度越大;反之豌习,二者偏差越写婊选;若兩個(gè)值完全相等時(shí)肥隆,卡方值就為0既荚,表明理論值完全符合。

特別注意:

  • 卡方檢驗(yàn)僅針對(duì)分類變量栋艳。
  • 用于計(jì)算列聯(lián)表的觀察是獨(dú)立的恰聘。
  • 列聯(lián)表的每個(gè)單元格中至少有25個(gè)實(shí)例。
  • 檢驗(yàn)原假設(shè):觀察頻數(shù)與期望頻數(shù)無顯著差異

用Python實(shí)現(xiàn)卡方校驗(yàn)

  • 借助第三方庫: scipy
    使用前需安裝scipy(Anaconda 已默認(rèn)安裝):
    pip install numpy
    pip install scipy
    
  • 卡方校驗(yàn)的實(shí)現(xiàn)需要借助scipy中的chi2_contingency模塊
    使用需前導(dǎo)入:
    from scipy.stats import chi2_contingency
    
    Python命令:chi2_contingency(data)

舉例:三種藥物的治療數(shù)據(jù)

image.png

Python代碼實(shí)現(xiàn):

import numpy as np
from scipy.stats import chi2_contingency

data = np.array([[38, 49, 25], [150, 98, 57]])
kf = chi2_contingency(data)
print('chisq-statistic=%.4f, p-value=%.4f, df=%i expected_frep=%s'%kf)

輸出結(jié)果:

chisq-statistic=7.9136, p-value=0.0191, df=2 expected_frep=[[ 50.4940048   39.48201439  22.02398082]
 [137.5059952  107.51798561  59.97601918]]

第一個(gè)值為卡方值,第二個(gè)值為P值晴叨,第三個(gè)值為自由度凿宾,第四個(gè)為與原數(shù)據(jù)數(shù)組同維度的對(duì)應(yīng)理論值

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