來源:foreach_break
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問題
給你1個文件bigdata,大小4663M在塔,5億個數(shù)幻件,文件中的數(shù)據(jù)隨機,如下一行一個整數(shù):
6196302
3557681
6121580
2039345
2095006
1746773
7934312
2016371
7123302
8790171
2966901
...
7005375
現(xiàn)在要對這個文件進(jìn)行排序,怎么搞蛔溃?
內(nèi)部排序
先嘗試內(nèi)排绰沥,選2種排序方式:
3路快排:
private final int cutoff = 8;
public void perform(Comparable[] a) {
? ? ? ? perform(a,0,a.length - 1);
? ? }
? ? private int median3(Comparable[] a,int x,int y,int z) {
? ? ? ? if(lessThan(a[x],a[y])) {
? ? ? ? ? ? if(lessThan(a[y],a[z])) {
? ? ? ? ? ? ? ? return y;
? ? ? ? ? ? }
? ? ? ? ? ? else if(lessThan(a[x],a[z])) {
? ? ? ? ? ? ? ? return z;
? ? ? ? ? ? }else {
? ? ? ? ? ? ? ? return x;
? ? ? ? ? ? }
? ? ? ? }else {
? ? ? ? ? ? if(lessThan(a[z],a[y])){
? ? ? ? ? ? ? ? return y;
? ? ? ? ? ? }else if(lessThan(a[z],a[x])) {
? ? ? ? ? ? ? ? return z;
? ? ? ? ? ? }else {
? ? ? ? ? ? ? ? return x;
? ? ? ? ? ? }
? ? ? ? }
? ? }
? ? private void perform(Comparable[] a,int low,int high) {
? ? ? ? int n = high - low + 1;
? ? ? ? //當(dāng)序列非常小,用插入排序
? ? ? ? if(n <= cutoff) {
? ? ? ? ? ? InsertionSort insertionSort = SortFactory.createInsertionSort();
? ? ? ? ? ? insertionSort.perform(a,low,high);
? ? ? ? ? ? //當(dāng)序列中小時贺待,使用median3
? ? ? ? }else if(n <= 100) {
? ? ? ? ? ? int m = median3(a,low,low + (n >>> 1),high);
? ? ? ? ? ? exchange(a,m,low);
? ? ? ? ? ? //當(dāng)序列比較大時徽曲,使用ninther
? ? ? ? }else {
? ? ? ? ? ? int gap = n >>> 3;
? ? ? ? ? ? int m = low + (n >>> 1);
? ? ? ? ? ? int m1 = median3(a,low,low + gap,low + (gap << 1));
? ? ? ? ? ? int m2 = median3(a,m - gap,m,m + gap);
? ? ? ? ? ? int m3 = median3(a,high - (gap << 1),high - gap,high);
? ? ? ? ? ? int ninther = median3(a,m1,m2,m3);
? ? ? ? ? ? exchange(a,ninther,low);
? ? ? ? }
? ? ? ? if(high <= low)
? ? ? ? ? ? return;
? ? ? ? //lessThan
? ? ? ? int lt = low;
? ? ? ? //greaterThan
? ? ? ? int gt = high;
? ? ? ? //中心點
? ? ? ? Comparable pivot =? a[low];
? ? ? ? int i = low + 1;
? ? ? ? /*
? ? ? ? * 不變式:
? ? ? ? *? ?a[low..lt-1] 小于pivot -> 前部(first)
? ? ? ? *? ?a[lt..i-1] 等于 pivot -> 中部(middle)
? ? ? ? *? ?a[gt+1..n-1] 大于 pivot -> 后部(final)
? ? ? ? *
? ? ? ? *? ?a[i..gt] 待考察區(qū)域
? ? ? ? */
? ? ? ? while (i <= gt) {
? ? ? ? ? ? if(lessThan(a[i],pivot)) {
? ? ? ? ? ? ? ? //i-> ,lt ->
? ? ? ? ? ? ? ? exchange(a,lt++,i++);
? ? ? ? ? ? }else if(lessThan(pivot,a[i])) {
? ? ? ? ? ? ? ? exchange(a,i,gt--);
? ? ? ? ? ? }else{
? ? ? ? ? ? ? ? i++;
? ? ? ? ? ? }
? ? ? ? }
? ? ? ? // a[low..lt-1] < v = a[lt..gt] < a[gt+1..high].
? ? ? ? perform(a,low,lt - 1);
? ? ? ? perform(a,gt + 1,high);
? ? }
歸并排序:
/**
?* 小于等于這個值的時候,交給插入排序
?*/
private final int cutoff = 8;
/**
?* 對給定的元素序列進(jìn)行排序
?*
?* @param a 給定元素序列
?*/
@Override
public void perform(Comparable[] a) {
? ? Comparable[] b = a.clone();
? ? perform(b, a, 0, a.length - 1);
}
private void perform(Comparable[] src,Comparable[] dest,int low,int high) {
? ? if(low >= high)
? ? ? ? return;
? ? //小于等于cutoff的時候,交給插入排序
? ? if(high - low <= cutoff) {
? ? ? ? SortFactory.createInsertionSort().perform(dest,low,high);
? ? ? ? return;
? ? }
? ? int mid = low + ((high - low) >>> 1);
? ? perform(dest,src,low,mid);
? ? perform(dest,src,mid + 1,high);
? ? //考慮局部有序 src[mid] <= src[mid+1]
? ? if(lessThanOrEqual(src[mid],src[mid+1])) {
? ? ? ? System.arraycopy(src,low,dest,low,high - low + 1);
? ? }
? ? //src[low .. mid] + src[mid+1 .. high] -> dest[low .. high]
? ? merge(src,dest,low,mid,high);
}
private void merge(Comparable[] src,Comparable[] dest,int low,int mid,int high) {
? ? for(int i = low,v = low,w = mid + 1; i <= high; i++) {
? ? ? ? if(w > high || v <= mid && lessThanOrEqual(src[v],src[w])) {
? ? ? ? ? ? dest[i] = src[v++];
? ? ? ? }else {
? ? ? ? ? ? dest[i] = src[w++];
? ? ? ? }
? ? }
}
數(shù)據(jù)太多麸塞,遞歸太深 ->棧溢出秃臣?加大Xss?
數(shù)據(jù)太多哪工,數(shù)組太長 -> OOM奥此?加大Xmx?
耐心不足,沒跑出來.而且要將這么大的文件讀入內(nèi)存雁比,在堆中維護(hù)這么大個數(shù)據(jù)量稚虎,還有內(nèi)排中不斷的拷貝,對棧和堆都是很大的壓力偎捎,不具備通用性蠢终。
sort命令來跑
sort -n bigdata -o bigdata.sorted
跑了多久呢?24分鐘.
為什么這么慢茴她?
粗略的看下我們的資源:
內(nèi)存
jvm-heap/stack寻拂,native-heap/stack,page-cache,block-buffer
外存
swap + 磁盤
數(shù)據(jù)量很大败京,函數(shù)調(diào)用很多兜喻,系統(tǒng)調(diào)用很多,內(nèi)核/用戶緩沖區(qū)拷貝很多赡麦,臟頁回寫很多朴皆,io-wait很高帕识,io很繁忙,堆棧數(shù)據(jù)不斷交換至swap遂铡,線程切換很多肮疗,每個環(huán)節(jié)的鎖也很多.
總之,內(nèi)存吃緊扒接,問磁盤要空間伪货,臟數(shù)據(jù)持久化過多導(dǎo)致cache頻繁失效,引發(fā)大量回寫钾怔,回寫線程高碱呼,導(dǎo)致cpu大量時間用于上下文切換,一切宗侦,都很糟糕愚臀,所以24分鐘不細(xì)看了,無法忍受.
很多問題其實答案很簡單矾利,但是背后的思考和邏輯不簡單姑裂,要做到知其然還要知其所以然。如果想學(xué)習(xí)Java工程化男旗、高性能及分布式舶斧、深入淺出。性能調(diào)優(yōu)察皇、Spring茴厉,MyBatis,Netty源碼分析的朋友點擊我的資料加群 561614305??让网,群里有阿里大牛直播講解技術(shù)呀忧,以及Java大型互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)的視頻免費分享給大家。
位圖法
private BitSet bits;
public void perform(
? ? ? ? String largeFileName,
? ? ? ? int total,
? ? ? ? String destLargeFileName,
? ? ? ? Castor castor,
? ? ? ? int readerBufferSize,
? ? ? ? int writerBufferSize,
? ? ? ? boolean asc) throws IOException {
? ? System.out.println("BitmapSort Started.");
? ? long start = System.currentTimeMillis();
? ? bits = new BitSet(total);
? ? InputPart largeIn = PartFactory.createCharBufferedInputPart(largeFileName, readerBufferSize);
? ? OutputPart largeOut = PartFactory.createCharBufferedOutputPart(destLargeFileName, writerBufferSize);
? ? largeOut.delete();
? ? Integer data;
? ? int off = 0;
? ? try {
? ? ? ? while (true) {
? ? ? ? ? ? data = largeIn.read();
? ? ? ? ? ? if (data == null)
? ? ? ? ? ? ? ? break;
? ? ? ? ? ? int v = data;
? ? ? ? ? ? set(v);
? ? ? ? ? ? off++;
? ? ? ? }
? ? ? ? largeIn.close();
? ? ? ? int size = bits.size();
? ? ? ? System.out.println(String.format("lines : %d ,bits : %d", off, size));
? ? ? ? if(asc) {
? ? ? ? ? ? for (int i = 0; i < size; i++) {
? ? ? ? ? ? ? ? if (get(i)) {
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? largeOut.write(i);
? ? ? ? ? ? ? ? }
? ? ? ? ? ? }
? ? ? ? }else {
? ? ? ? ? ? for (int i = size - 1; i >= 0; i--) {
? ? ? ? ? ? ? ? if (get(i)) {
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? largeOut.write(i);
? ? ? ? ? ? ? ? }
? ? ? ? ? ? }
? ? ? ? }
? ? ? ? largeOut.close();
? ? ? ? long stop = System.currentTimeMillis();
? ? ? ? long elapsed = stop - start;
? ? ? ? System.out.println(String.format("BitmapSort Completed.elapsed : %dms",elapsed));
? ? }finally {
? ? ? ? largeIn.close();
? ? ? ? largeOut.close();
? ? }
}
private void set(int i) {
? ? bits.set(i);
}
private boolean get(int v) {
? ? return bits.get(v);
}
nice!跑了190秒溃睹,3分來鐘.
以核心內(nèi)存4663M/32大小的空間跑出這么個結(jié)果而账,而且大量時間在用于I/O,不錯.
問題是因篇,如果這個時候突然內(nèi)存條壞了1泞辐、2根,或者只有極少的內(nèi)存空間怎么搞竞滓?
外部排序
該外部排序上場了.
外部排序干嘛的咐吼?
內(nèi)存極少的情況下,利用分治策略商佑,利用外存保存中間結(jié)果锯茄,再用多路歸并來排序;
map-reduce的嫡系.
1.分
內(nèi)存中維護(hù)一個極小的核心緩沖區(qū)memBuffer,將大文件bigdata按行讀入,搜集到memBuffer滿或者大文件讀完時肌幽,對memBuffer中的數(shù)據(jù)調(diào)用內(nèi)排進(jìn)行排序晚碾,排序后將有序結(jié)果寫入磁盤文件bigdata.xxx.part.sorted.
循環(huán)利用memBuffer直到大文件處理完畢,得到n個有序的磁盤文件:
2.合
現(xiàn)在有了n個有序的小文件喂急,怎么合并成1個有序的大文件格嘁?
把所有小文件讀入內(nèi)存,然后內(nèi)排廊移?
(⊙o⊙)…
no!
利用如下原理進(jìn)行歸并排序:
我們舉個簡單的例子:
文件1:3,6,9
文件2:2,4,8
文件3:1,5,7
第一回合:
文件1的最小值:3 , 排在文件1的第1行
文件2的最小值:2糕簿,排在文件2的第1行
文件3的最小值:1,排在文件3的第1行
那么狡孔,這3個文件中的最小值是:min(1,2,3) = 1
也就是說懂诗,最終大文件的當(dāng)前最小值,是文件1苗膝、2响禽、3的當(dāng)前最小值的最小值,繞么荚醒?
上面拿出了最小值1,寫入大文件.
第二回合:
文件1的最小值:3 , 排在文件1的第1行
文件2的最小值:2隆嗅,排在文件2的第1行
文件3的最小值:5界阁,排在文件3的第2行
那么,這3個文件中的最小值是:min(5,2,3) = 2
將2寫入大文件.
也就是說胖喳,最小值屬于哪個文件泡躯,那么就從哪個文件當(dāng)中取下一行數(shù)據(jù).(因為小文件內(nèi)部有序,下一行數(shù)據(jù)代表了它當(dāng)前的最小值)
最終的時間丽焊,跑了771秒较剃,13分鐘左右.
less bigdata.sorted.text
...
9999966
9999967
9999968
9999969
9999970
9999971
9999972
9999973
9999974
9999975
9999976
9999977
9999978
...