測序知識
- 區(qū)分一二三代
- 二代流程
- NGS組學
測序過程和原理
一代sanger sequencing
sanger sequencing.png
- 測序讀長可達1000bp，準確性高達99.999%
- 聚合酶活性下降谓松，一次只測一條拳氢，通量低
二代測序
- Roche：454技術
- illumina：Solexa/Hiseq
- ABI：SOLID技術
illunima Hiseq 測序原理
PE (Pair End)
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flowcell： 測序反應的載體/容器，1個flowcell有8個lane
flow cell.png - lane： 測序反應的平行泳道越败，試劑添加、洗脫等過程的發(fā)生位置
- tile： 每次熒光掃描的位置硼瓣，肉眼是看不到的
- 雙端測序： 可能序列比較長有四五百bp究飞，兩邊各測120-150bp
- junction： 雙端測序中間一些沒有測到的區(qū)域
- flowcell構造：一個lane包含兩列（swath），每一列有60個tile堂鲤，每個tile會種下不同的cluster亿傅，每個tile在一次循環(huán)中會拍照4次（每個堿基一次）
-sequence by synthesis SBS
原理介紹視頻：https://share.weiyun.com/5qojuBY 密碼： 密碼：bxsry4
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構建文庫
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測序知識
學習小組Day7思維導圖-一二三代測序.png
day7學習未完待續(xù)
