???Hello勤庐，小伙伴們，大家好变过！
? ? ? ?還在為CG View Server埃元，GeneWiz browser等網(wǎng)址限制比較基因組數(shù)目而苦惱嗎涝涤？還在為Circos媚狰、BLASTAtlas等軟件命令腳本看不懂而煩惱嗎？我該怎么辦阔拳？我該怎么畫出比較基因組圈圖呢崭孤？??為了解決大家的困擾，密碼子學(xué)院專門制作了BRIG軟件繪制比較基因組圈圖的課程糊肠，只需在Windows界面下就可以直接使用辨宠，簡單、快捷货裹、易懂嗤形、易操作。
? ? ? ?接下來跟著小編來了解一下BRIG軟件吧弧圆！近年來赋兵，隨著下一代測序技術(shù)的普及，越來越來的科研人員通過比較基因組來研究自己基因組的特征搔预，如基因組的信息：GC含量霹期，GC skew，Contig片段拯田、毒力組島历造、可移動遺傳元件（質(zhì)粒、噬菌體船庇、轉(zhuǎn)座子吭产、整合子、插入序列共同區(qū)等）以及毒力因子鸭轮、重金屬與耐藥基因等在同源物種間的分布情況臣淤。因?yàn)锽RIG軟件操作簡單，越來越多的科研人員使用BRIG繪圖张弛，從NCBI PMC數(shù)據(jù)庫中來說荒典，大約有1043篇文章使用BRIG軟件進(jìn)行圈圖的繪制酪劫，僅2020年發(fā)表的SCI論文就有177篇左右，可見BRIG軟件的使用頻率是非常高的寺董。
?今天密碼子學(xué)院比較基因組圈圖的課程上線了，給大家?guī)Ц＠苏诳В赓M(fèi)領(lǐng)取課程了滩字，手快有御吞，手慢無了！Ｌ罩椤！本課程上線于千聊視頻平臺揍诽，只要分享本文到朋友圈诀蓉，然后截圖發(fā)給客服小唯（關(guān)注密碼子實(shí)驗(yàn)室暑脆，聯(lián)系小唯）渠啤，將會獲得優(yōu)惠碼免費(fèi)觀看本課程。（免費(fèi)活動2020/9/21-2020/9/25）
BRIG軟件介紹
BRIG軟件將快速帶你走進(jìn)比較基因組圈圖的繪制添吗，讓你更加了解基因組詳細(xì)的信息沥曹。BRIG(BLAST Ring Image Generator) 是由Java編寫的，使用BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）進(jìn)行基因組的比對分析且由CG View進(jìn)行圖像生成的一款軟件碟联。生物基因組比較結(jié)果可視化能夠很好的展示同源關(guān)系較為密切的物種基因組之間的差異妓美。目前市場上的很多軟件對于基因組的數(shù)目都有限制，或者必須基于命令行玄帕，操作不便部脚。BRIG是一款操作簡單且功能強(qiáng)大的分析及可視化的軟件，不需要復(fù)雜的命令行裤纹，屬于圖形化操作界面委刘，易懂且上手簡單，能夠在一張圖中展示近百個(gè)基因組掃描圖或者完成圖比較結(jié)果鹰椒。
??以下是近年來通過BRIG軟件發(fā)表的有關(guān)比較基因組文章中的圈圖锡移，讓大家可以更加直觀地了解一下BRIG軟件的魅力。
?? 接下來小編給大家簡單的介紹一下使用BRIG軟件發(fā)表的文章，從NCBI數(shù)據(jù)庫隨機(jī)找了前10篇文獻(xiàn)。如下表所示男公，從下面文章的影響因子（IF）與關(guān)鍵詞静盅，我們可以看出BRIG軟件的應(yīng)用范圍比較廣，主要應(yīng)用于微生物基因組與質(zhì)涟幔基因組的比較埂奈，研究同源關(guān)系若贮，致病性戳吝，獨(dú)有的可移動遺傳元件等
表1 BRIG軟件文章統(tǒng)計(jì)
文章期刊影響因子（**IF）**
Phylogenetic Grouping of Human Ocular Escherichia? coli Based on Whole-Genome Sequence AnalysisMicroorganisms4.152
Horizontal Plasmid Transfer among Klebsiella? pneumoniae Isolates Is the Key Factor for Dissemination of? Extended-Spectrum β-Lactamases among Children in TanzaniamSphere.4.282
Comparative genomic analysis of a Shiga? toxin-producing Escherichia coli (STEC) O145:H25 associated? with a severe pediatric case of hemolytic uremic syndrome in Davidson County,? Tennessee, USBMC? ? Genomics.3.594
Isolation of Mycoplasma anserisalpingitidis from? swan goose (Anser cygnoides) in ChinaBMC? Vet Res1.835
Biphasic Outbreak of Invasive Group A Streptococcus Disease? in Eldercare Facility, New ZealandEmerg? Infect Dis.6.259
Genome-Guided Mass Spectrometry Expedited the? Discovery of Paraplantaricin TC318, a Lantibiotic Produced by Lactobacillus? paraplantarum Strain Isolated From CheeseFront? Microbiol4.235
Genomic Epidemiology of Carbapenem- and Colistin-Resistant Klebsiella? pneumoniae Isolates From Serbia: Predominance of ST101 Strains? Carrying a Novel OXA-48 PlasmidFront? Microbiol4.235
Is Shiga Toxin-Producing Escherichia coli O45? No Longer a Food Safety Threat? The Danger is Still Out ThereMicroorganisms4.152
Investigating Bacteriophages Targeting the? Opportunistic Pathogen Acinetobacter baumanniiAntibiotics (Basel).3.893
Genome-Wide Analyses Revealed Remarkable? Heterogeneity in Pathogenicity Determinants, Antimicrobial Compounds, and? CRISPR-Cas Systems of Complex Phytopathogenic Genus PectobacteriumPathogens.3.018
