感謝CJ大神的反復(fù)修改，這個功能越變越好了象迎！
本文旨在復(fù)現(xiàn)CJ大神推文內(nèi)容丹擎，具體請參考“省心炸雞”，手動狗頭（http://www.reibang.com/p/b9034ce82ec2）
首先需要獲取的是染色體位置刽宪，我的辦法是在GFF3文件里取得。
復(fù)制出來的文件都在同一個單元格里，這個時候只需要使用分列功能就能把信息分開瓜富。
保存為txt文件
| Chr | Length |
|---|---|
| 1A | 594102056 |
| 1B | 689851870 |
| 1D | 495453186 |
| 2A | 780798557 |
| 2B | 801256715 |
| 2D | 651852609 |
| 3A | 750843639 |
| 3B | 830829764 |
| 3D | 615552423 |
| 4A | 744588157 |
| 4B | 673617499 |
| 4D | 509857067 |
| 5A | 709773743 |
| 5B | 713149757 |
| 5D | 566080677 |
| 6A | 618079260 |
| 6B | 720988478 |
| 6D | 473592718 |
| 7A | 736706236 |
| 7B | 750620385 |
| 7D | 638686055 |
之后需要準(zhǔn)備基因位置文件，首先用tbtools提取所有基因的ID和位置降盹。這里使用GFF3 gene position parse与柑。正經(jīng)的IOS（input，output，start）流程沒什么可說的价捧。
之后再input之前獲得的文件丑念。在set condition text填入需要提取的gene ID。模式選擇包含（contain）干旧，過濾模式選擇提惹邸（extract）。
需要注意的是椎眯，提取出來的文件行列不能直接使用挠将，需要設(shè)置table行列。
第一列g(shù)ene或者transcript ID编整，第二列chromosome舔稀，第三列起始位置，第四列結(jié)束為止掌测，第五列圖形分組（從0開始排起内贮，目前只試過四種最多幾種不清楚）。需要注意的是汞斧，該功能里merge會把不同顏色的基因堆疊在一起夜郁，而如果ID來自不同的圖形分組（第五列信息）則不會。
填入對應(yīng)信息即可
默認(rèn)全部分成一組的話粘勒，你就能得到
顯然沒什么意義竞端，分成三組，再加入顏色信息庙睡。
說個題外話事富，關(guān)于顏色的批量填充，在excel里按照組分類可以寫個if套娃乘陪，例如下面這樣
=if(c1=0,"253,180,98",if(c1=1,"228,26,28","31,120,180"))
也可以寫個index统台，然后用match去返回需要的顏色標(biāo)簽（R,G,B）
=INDEX({"253,180,98","228,26,28","31,120,180"},MATCH(C1,{0,1,2},0))
同理，你可以用類似方法給自己的基因批量分類啡邑。
最后的最后贱勃，一定要換形狀，否則merge的時候信息會出錯谣拣。
哦對了 基因密度信息請參考這里：http://www.reibang.com/p/801807865864
最后募寨，祝大家磕鹽順利
