⑩??[目錄](méi)哈醫(yī)大數(shù)據(jù)庫(kù)⑨LncRNA Ontology轿衔、BioM2MetDisease

  1. 哈醫(yī)數(shù)據(jù)庫(kù)①Lnc2Cancer沉迹、Lnc2Meth、LncACTdb害驹、MSDD
  2. 哈醫(yī)數(shù)據(jù)庫(kù)②miRSponge鞭呕、Co-LncRNA、FACER
  3. 哈醫(yī)數(shù)據(jù)庫(kù)③LncMAP宛官、LNCat
  4. 哈醫(yī)數(shù)據(jù)庫(kù)④CellMarker葫松、GPA
  5. 哈醫(yī)數(shù)據(jù)庫(kù)⑤TIP、SEECancer
  1. 哈醫(yī)數(shù)據(jù)庫(kù)⑥LnChrom、DiseaseEnhancer
  2. 哈醫(yī)數(shù)據(jù)庫(kù)⑦miRNA targets费变、NSDNA
  3. 哈醫(yī)數(shù)據(jù)庫(kù)⑧Ubetis-LncDB摧扇、LincSNP

  • LncRNA Ontology旨在根據(jù)染色質(zhì)狀態(tài)和表達(dá)模式推斷l(xiāng)ncRNA的功能。 總共9種組蛋白修飾標(biāo)記(H2A.Z胡控,H3K4me1 / 2/3扳剿,H3K9ac旁趟,H3K27ac昼激,H3K9me3庇绽,H3K27me3和H3K36me3)與13種不同人類(lèi)細(xì)胞類(lèi)型中l(wèi)ncRNA和mRNA的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)(TSS)相關(guān)(and their expression were considered)。 我們使用nearest shrunken centroid algorithm橙困,我們?yōu)槊總€(gè)Gene Ontology term建模瞧掺,使用了10 profiles of mRNAs 分析,并證明將色譜狀態(tài)與轉(zhuǎn)錄特征相結(jié)合可以產(chǎn)生比單個(gè)數(shù)據(jù)集模型訓(xùn)練更好的基因功能預(yù)測(cè)凡傅。 通過(guò)應(yīng)用我們的基于染色質(zhì)的模型辟狈,預(yù)測(cè)了超過(guò)97%的人類(lèi)lncRNA的可能功能。 我們基于基因本體的層次結(jié)構(gòu)( hierarchical structure of gene ontology)開(kāi)發(fā)了** LncRNA Ontology(LO)**夏跷。 LO為用戶(hù)提供查看lncRNA的預(yù)測(cè)功能的資源哼转。
  • 用戶(hù)可以在LncRNA Ontology. 中搜索和下載查詢(xún)lncRNA或 term的lncRNA-term關(guān)聯(lián)
    點(diǎn)擊"Help" 可以獲取 LncRNA Ontology的更多細(xì)節(jié)信息.
LncRNA Ontology

相關(guān)文獻(xiàn)
LncRNA ontology: inferring lncRNA functions based on chromatin states and expression patterns


  • 21.BioM2MetDisease
    • 簡(jiǎn)介 :BioM2MetDisease數(shù)據(jù)庫(kù)存儲(chǔ)了microRNA,代謝物槽华,小分子和代謝疾病之間的關(guān)聯(lián)
  • BioM2MetDisease是一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)壹蔓,旨在建立各種代謝疾病和生物分子之間的關(guān)聯(lián)。 在目前的版本中猫态,BioM2MetDisease提供了2681個(gè)手動(dòng)收集的關(guān)聯(lián)佣蓉,包括524個(gè)miRNA和45個(gè)代謝疾病之間的關(guān)系; 281種代謝產(chǎn)物和35種代謝疾病; 來(lái)自近1300篇已發(fā)表文獻(xiàn)的14種物種中的349種小分子(或藥物)和57種代謝疾病(不同物種中的相同生物分子僅計(jì)數(shù)一次)
  • Metabolic disease also known as metabolic disorder, 已成為人們健康的主要威脅之一亲雪。 新出現(xiàn)的證據(jù)表明勇凭,代謝疾病與多種生物分子的異常水平有關(guān)。
  • MicroRNA是一種含有約22個(gè)核苷酸的小型非編碼RNA分子义辕,其在RNA沉默和post-transcriptional regulation of gene expression起作用虾标。 有證據(jù)表明,microRNA在許多人類(lèi)疾病中起著關(guān)鍵作用终息,包括代謝疾病夺巩。
    代謝產(chǎn)物是新陳代謝的中間體和產(chǎn)物,它直接反映生物系統(tǒng)的生理狀態(tài)周崭。 越來(lái)越多的證據(jù)表明柳譬,代謝產(chǎn)物也與代謝疾病密切相關(guān)。
    小分子(或藥物)可以調(diào)節(jié)多種生物過(guò)程续镇,并已被用于治療人類(lèi)疾病美澳。


    BioM2MetDisease

相關(guān)文獻(xiàn):
BioM2MetDisease: a manually curated database for associations between microRNAs, metabolites, small molecules and metabolic diseases

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