2019.12.4
不知道為啥我的注冊碼激活不了供炎，試了很久，都不行妙啃，哎档泽。出現(xiàn)Please use the OmicsBox Launcher的錯誤。記錄一下老師上課演示的吧揖赴。
分子標記被SNP代替（SSR沒那么好了）
Blast2GO（商用）基因注釋
現(xiàn)在很重要的是：二代馆匿、三代測序數(shù)據(jù)的分析、SNP個體的基因型燥滑。
結果Hits20（比對NR庫渐北，20條序列），會有的沒比對上铭拧。GO數(shù)據(jù)庫局部有的會比NR庫詳細赃蛛。
OmicsBox Example Workflows
fasta-blast-mappping-annotation-graphs-charts（blast花費時間最長）
(1) Load-Load Sequences-Load Example Sequences(比對完成，字體顏色變成藍色)
(2) Load-Load Blast Results-Load Blast Results(XML/Zip)-Create new project-select folder(直接導入文件夾羽历，選擇add files也行焊虏，導入文件)?
(3) functional analysis-Blast2GO Mapping-Run GO Mapping
(4)?functional analysis-Blast2GO Annotation-Run Annotation-Blast-Species Distribution
選擇Number of GOs/Seq-Length? ? ?GO Distribution by level 點擊run。
GO IDS有3條 F分子功能? ?C細胞組分
GO注釋：詞條描述（BP生物過程秕磷、MF分子功能诵闭、CC細胞組分）結果點右鍵(GO IDS上)-Mapping graph
基因注釋就是那樣，沒那么復雜澎嚣。代謝組畫不出來（在KEGG里畫）
EC:酶 右擊疏尿，沒有KEGG詞條（在DDBJ里）提交酶序列號，進行注釋易桃。Blast2GO? EC:酶 右擊褥琐，以前有KEGG，現(xiàn)在沒有了晤郑。
基因組有幾萬個SNP敌呈，表型和分子連接點贸宏。
表型、SNP（測得的）磕洪，用全基因組關聯(lián)分析吭练。
高通量測序數(shù)據(jù)，會用perl編程析显，把信息提取出來鲫咽，用代碼分析VCR,用perl提取基因型。
