在R中找不到python和conda

安裝的R包需要使用python搭建的包途蒋,報錯如下:

/> scAI_outs <- identifyClusters(scAI_outs, resolution = 1)
Error in runLeiden(SNN = snn, resolution = resolution, partition_type = partition.type, :
Cannot find Leiden algorithm, please install through pip (e.g. pip install leidenalg).

因此想用reticulate包在R中調(diào)用python去安裝,結(jié)果找不到conda.exe窜护?助赞?明明電腦里有的
網(wǎng)上一搜也全都是成功使用reticulate的例子买羞,沒什么失敗的。雹食。

/> py_available()
[1] FALSE
/> repl_python()
Error: Specified conda binary 'C:/PROGRA~3 /ANACON~1/Scripts/conda.exe' does not exist.

我一開始以為是自己電腦conda沒裝好畜普,然后試了試用來裝軟件是正常的,安裝的jupyter notebook都跑的好好的
就在要放棄的時候群叶,想了想自己都是百度找的吃挑,經(jīng)驗可能不全,去google了一下街立,能搜到很多類似的問題舶衬,參考了https://github.com/rstudio/keras/issues/256

/>Sys.setenv(RETICULATE_PYTHON="C:\\ProgramData\\Miniconda3\\python.exe")

指定路徑后再測試一下,果然好了呢赎离!

/>repl_python()
Python 3.7.3 (C:/ProgramData/Miniconda3/python.exe)
Reticulate 1.16 REPL -- A Python interpreter in R.
/> py_available()
[1] TRUE

開心逛犹!

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個濱河市梁剔,隨后出現(xiàn)的幾起案子虽画,更是在濱河造成了極大的恐慌,老刑警劉巖荣病,帶你破解...
    沈念sama閱讀 219,110評論 6 508
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件码撰,死亡現(xiàn)場離奇詭異,居然都是意外死亡个盆,警方通過查閱死者的電腦和手機脖岛,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 93,443評論 3 395
  • 文/潘曉璐 我一進店門,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來颊亮,“玉大人鸡岗,你說我怎么就攤上這事”嘈郑” “怎么了决乎?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 165,474評論 0 356
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵砚婆,是天一觀的道長愚铡。 經(jīng)常有香客問我,道長悯嗓,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 58,881評論 1 295
  • 正文 為了忘掉前任卸察,我火速辦了婚禮脯厨,結(jié)果婚禮上,老公的妹妹穿的比我還像新娘坑质。我一直安慰自己合武,他們只是感情好,可當我...
    茶點故事閱讀 67,902評論 6 392
  • 文/花漫 我一把揭開白布涡扼。 她就那樣靜靜地躺著稼跳,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪吃沪。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上汤善,一...
    開封第一講書人閱讀 51,698評論 1 305
  • 那天,我揣著相機與錄音票彪,去河邊找鬼红淡。 笑死,一個胖子當著我的面吹牛降铸,可吹牛的內(nèi)容都是我干的在旱。 我是一名探鬼主播,決...
    沈念sama閱讀 40,418評論 3 419
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼推掸,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼桶蝎!你這毒婦竟也來了?” 一聲冷哼從身側(cè)響起终佛,我...
    開封第一講書人閱讀 39,332評論 0 276
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎雾家,沒想到半個月后铃彰,有當?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 45,796評論 1 316
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡芯咧,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 37,968評論 3 337
  • 正文 我和宋清朗相戀三年牙捉,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學(xué)時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片敬飒。...
    茶點故事閱讀 40,110評論 1 351
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡邪铲,死狀恐怖,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出无拗,到底是詐尸還是另有隱情带到,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 35,792評論 5 346
  • 正文 年R本政府宣布英染,位于F島的核電站揽惹,受9級特大地震影響被饿,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜搪搏,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 41,455評論 3 331
  • 文/蒙蒙 一狭握、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧疯溺,春花似錦论颅、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 32,003評論 0 22
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至挠说,卻和暖如春澡谭,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背损俭。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 33,130評論 1 272
  • 我被黑心中介騙來泰國打工蛙奖, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人杆兵。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 48,348評論 3 373
  • 正文 我出身青樓雁仲,卻偏偏與公主長得像,于是被迫代替她去往敵國和親琐脏。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子攒砖,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 45,047評論 2 355