1递沪、創(chuàng)建賬號
將數(shù)據(jù)上傳到GEO數(shù)據(jù)庫勇蝙，首先要創(chuàng)建并登陸NCBI帳號沫勿， 然后進入提交的網(wǎng)址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/submission.html
以高通量測序數(shù)據(jù)為例：
2.準備文件
點進去需要填寫三個文件，分別為：Metadata spreadsheet味混、Processed data files产雹、Raw data files。下面分別介紹每個文件如何填寫翁锡。
下載Metadata spreadsheet表格
3.填寫文件
Metadata spreadsheet提供了兩個例子蔓挖，每個填寫的欄目都給出了提示和說明馆衔，也可以根據(jù)給出的示例進行填寫：
image.png
4.數(shù)據(jù)上傳
返回下載metadata示例的[網(wǎng)址(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/seq.html)
拉到最下面點擊transfer files。
轉(zhuǎn)到提交數(shù)據(jù)操作的網(wǎng)頁
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/submissionftp.html
數(shù)據(jù)上傳給出了詳細的步驟角溃，step1給出了上傳的位置。
在linux可以使用 lftp進行上傳减细，上傳的代碼在上面example linux sessions已經(jīng)給出匆瓜，只需要自己將Folder_with_submission_files改成自己要上傳數(shù)據(jù)的絕對路徑的文件目錄即可。
#conda安裝lftp
conda install lftp
#下面的代碼geo已給出，直接復(fù)制即可
lftp ftp://geoftp:xxx(passward in step f.)@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov
cd uploads/xxx(step1創(chuàng)建的路徑名)
#Folder_with_submission_files為存放文件的路徑
mirror -R Folder_with_submission_files
Mac或者windows電腦也可以通過FileZilla進行上傳，點擊上面example Mac/ Windows賬號密碼以及操作流程都提供了詳細的說明,按步驟一步步來就好左冬。
