服務(wù)器上安裝Rstudio-server

R語言是生信分析、數(shù)據(jù)挖掘最常用最好用的軟件之一扼仲,得到了廣大生信工程師、數(shù)據(jù)分析師的厚愛抄淑。Rstudio 是 R 的集成開發(fā)環(huán)境屠凶,使得R語言的用戶體驗(yàn)更強(qiáng)。
以下安裝均在管理員賬號(hào)下完成肆资,或者個(gè)人賬號(hào)下有管理員授權(quán)(sudo)矗愧;單純個(gè)人賬號(hào)下安裝 R 語言可以使用 Anaconda(conda install r-base),但是無法完成 Rstudio-server 的安裝和使用郑原。

方法1:使用Docker安裝

參考:

「r<-教程」R Docker 教程
在linux(ubuntu)中使用網(wǎng)頁(yè)版的rstudio
docker 安裝Rstudio唉韭,遠(yuǎn)程生成圖表
Rstudio Server + Docker + tensorflowR - 云端安裝與使用R語言與GPU深度學(xué)習(xí)
Rstudio Server的安裝和使用(附常見問題)
如何修改RStudio Server密碼


實(shí)踐:

第一步:安裝Docker夜涕,詳見官網(wǎng)

https://docs.docker.com/get-started/

第二步:pull 鏡像到本地,在宿主機(jī)上創(chuàng)建/home/kcao/R 文件夾属愤,并運(yùn)行運(yùn)行Rstudio容器

  • 將本地文件夾/home/rstudio/r-docker-tutorial 掛載到docker實(shí)例文件夾/home/rstudio/r-docker-tutorial中
  • 啟動(dòng)端口8787女器;
$ mkdir -p  /home/kcao/R
$ docker run -d  -e PASSWORD=xxxxxx -v /home/rstudio/r-docker-tutorial:/home/rstudio/r-docker-tutorial --name rstuido -p 8787:8787 rocker/rstudio

第三步:設(shè)置xshell隧道

設(shè)置8787端口

img

第四步:在本地瀏覽器中使用Rstudio

username:rstudio
password:就是第二步中設(shè)置的 xxxxxx

效果:http://localhost:8787/

img

第五步:設(shè)置騰訊云防火墻合蔽,開放8787端口

如果想直接通過IP進(jìn)行登錄算灸,類似訪問網(wǎng)頁(yè)那種效果诲祸,有一個(gè)瀏覽器就可以打開周荐,甚至ipad上面也可以編程;

img

第六步:效果:

通過IP+端口涧卵,通過不同設(shè)備訪問Rstudio 埃篓;
http://49.235.78.63:8787/
賬號(hào)密碼同上察净;


img

方法2:自己手動(dòng)安裝

參考:

如何在 CentOS 系統(tǒng)上安裝 Rstudio-server
https://zhuanlan.zhihu.com/p/101988060
查看Redhad7.6版本系統(tǒng)上防火墻狀態(tài)時(shí)吼句,看到了下面的提示
https://www.cnblogs.com/wayneliu007/p/10372601.html
在服務(wù)器中使用R--RStudio Server


實(shí)踐:

第一步:R 語言的安裝(yum install)

進(jìn)入管理員賬號(hào)并安裝的代碼如下:

yum -y install epel-release
yum -y install R

第二步:Rstudio-server 安裝

登錄 Rstudio 官網(wǎng)(RStudio | Open source & professional software for data science teams),在 Products 選項(xiàng)卡中選擇 Rstudio Server事格,而后找到并選擇 DOWNLOAD SERVER 如圖:

img

img

img

img

第三步:必要的設(shè)置

  • 查看安裝位置
$ which rstudio-server
$ which R
  • 確定安裝路徑惕艳,并添加文件 rserver.conf
$ vim /etc/rstudio/rserver.conf

# Server Configuration File
www-port = 8790
rsession-which-r=/usr/bin/R
auth-timeout-minutes=0
auth-stay-signed-in-days=30
  • 其中 rsession-which-r= 后面為 R 的安裝路徑。然后保存退出驹愚,并添加文件 rsession.conf. 保存退出远搪。
$ vim /etc/rstudio/rsession.conf

# R Session Configuration File
www-port = 8787
  • 配置也大致完成,最后還有防火墻設(shè)置逢捺。先關(guān)閉系統(tǒng)防火墻:打開 Rstudio-server谁鳍,并查看狀態(tài):
$ systemctl stop firewalld.service

$ rstudio-server start
$ rstudio-server status

(base) [17:19:35] root@VM-4-4-centos:~
$ rstudio-server status
● rstudio-server.service - RStudio Server
   Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/rstudio-server.service; enabled; vendor preset: disabled)
   Active: active (running) since Sun 2021-10-10 17:19:35 CST; 2s ago
  Process: 23222 ExecStop=/usr/bin/killall -TERM rserver (code=exited, status=0/SUCCESS)
  Process: 23223 ExecStart=/usr/lib/rstudio-server/bin/rserver (code=exited, status=0/SUCCESS)
 Main PID: 23233 (rserver)
    Tasks: 3
   Memory: 86.8M
   CGroup: /system.slice/rstudio-server.service
           └─23233 /usr/lib/rstudio-server/bin/rserver

Oct 10 17:19:35 VM-4-4-centos systemd[1]: Starting RStudio Server...
Oct 10 17:19:35 VM-4-4-centos systemd[1]: Started RStudio Server.
  • 此時(shí)可以訪問 Rstudio-server 了,但是防火墻需要設(shè)置一個(gè)端口為 8790(Rstudio-server的端口)的白名單(--permanent 表示永久):
firewall-cmd --zone=public --add-port=8790/tcp --permanent 
  • 最后別忘了重新打開防火墻劫瞳,并查看狀態(tài):
$ systemctl start firewalld.service
$ systemctl status firewalld.service
img

第四步:一些必要的插件

為了后續(xù)的使用以及 R 包的安裝倘潜,需要安裝一些插件,如下:

$ yum -y install openssl-devel libxml2-devel zlib java gcc-gfortran gcc gcc-c++ readline-devel libXt-devel bzip2-devel bzip2-libs xz-devel pcre-devel libcurl-devel libxslt-devel aspell-devel openldap libjpep-devel gmp-devel mpfr-devel cairo-devel proj-devel gdal-devel libtiff-devel librsvg2-devel udunits2-devel

第五步:其他

  • 此時(shí)直接通過IP訪問還是不行志于,需要開啟騰訊云服務(wù)器上面的防火墻端口


    img
  • 最后一步:添加一個(gè)普通賬戶
    前面都是用root賬號(hào)在安裝操作涮因,但RStudio Server基于安全考慮不允許使用root賬號(hào)登錄,因此伺绽,我們需要?jiǎng)?chuàng)建一個(gè)新的賬號(hào)來使用RStudio Server养泡。

類似下面的操作:


img

第六步:最終效果

http://49.235.78.63:8790/
賬戶&密碼:見第五步操作;

img

歡迎評(píng)論交流~

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末奈应,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市澜掩,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌杖挣,老刑警劉巖肩榕,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,839評(píng)論 6 482
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異程梦,居然都是意外死亡点把,警方通過查閱死者的電腦和手機(jī)橘荠,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,543評(píng)論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來郎逃,“玉大人哥童,你說我怎么就攤上這事“玻” “怎么了贮懈?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 153,116評(píng)論 0 344
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀的道長(zhǎng)优训。 經(jīng)常有香客問我朵你,道長(zhǎng),這世上最難降的妖魔是什么揣非? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 55,371評(píng)論 1 279
  • 正文 為了忘掉前任抡医,我火速辦了婚禮,結(jié)果婚禮上早敬,老公的妹妹穿的比我還像新娘忌傻。我一直安慰自己,他們只是感情好搞监,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,384評(píng)論 5 374
  • 文/花漫 我一把揭開白布水孩。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般琐驴。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪俘种。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開封第一講書人閱讀 49,111評(píng)論 1 285
  • 那天绝淡,我揣著相機(jī)與錄音宙刘,去河邊找鬼。 笑死够委,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛荐类,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播茁帽,決...
    沈念sama閱讀 38,416評(píng)論 3 400
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼玉罐,長(zhǎng)吁一口氣:“原來是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼!你這毒婦竟也來了潘拨?” 一聲冷哼從身側(cè)響起吊输,我...
    開封第一講書人閱讀 37,053評(píng)論 0 259
  • 序言:老撾萬榮一對(duì)情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎铁追,沒想到半個(gè)月后季蚂,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,558評(píng)論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 36,007評(píng)論 2 325
  • 正文 我和宋清朗相戀三年扭屁,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了算谈。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 38,117評(píng)論 1 334
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡料滥,死狀恐怖然眼,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情葵腹,我是刑警寧澤高每,帶...
    沈念sama閱讀 33,756評(píng)論 4 324
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站践宴,受9級(jí)特大地震影響鲸匿,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜阻肩,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,324評(píng)論 3 307
  • 文/蒙蒙 一带欢、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧烤惊,春花似錦洪囤、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 30,315評(píng)論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)喇完。三九已至伦泥,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間锦溪,已是汗流浹背不脯。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 31,539評(píng)論 1 262
  • 我被黑心中介騙來泰國(guó)打工, 沒想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留刻诊,地道東北人防楷。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,578評(píng)論 2 355
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像则涯,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親复局。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,877評(píng)論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容