MOVICS包導(dǎo)入數(shù)據(jù)步驟
library("MOVICS")
# load example data of breast cancer1.載入示例數(shù)據(jù)
load(system.file("extdata", "brca.tcga.RData", package = "MOVICS", mustWork = TRUE))
names(brca.tcga)
sapply(brca.tcga, dim)
可以看出弓候，brca.tcga中有以下幾個數(shù)據(jù)集
image.png
從sapply函數(shù)中可以看出幾個數(shù)據(jù)集行可不同砖织，但列相同垢村。那我們看看行瑟捣，列分別代表什么
mo.data$mRNA.expr[1:5,1:5]
mo.data$lncRNA.expr[1:5,1:5]
mo.data$meth.beta[1:5,1:5]
mo.data$mut.status[1:5,1:5]
image.png
image.png
可以看出行代表基因等馋艺，列代表樣本。
