Hi-Net 多模態(tài)混合醫(yī)學(xué)圖像生成網(wǎng)絡(luò)2020-05-28

今日文章來(lái)自:Hi-Net: Hybrid-fusion Network for Multi-modalMR Image Synthesis1

研究任務(wù)和思想

文章研究任務(wù)為醫(yī)學(xué)圖像生成祥得。傳統(tǒng)的醫(yī)學(xué)圖像生成一般是一種模態(tài)生成另一種模態(tài),而本文的任務(wù)為兩種或者模態(tài)生成另一種模態(tài)蒋得,如輸入T1 和T2兩種模態(tài)生成Flair模態(tài)级及。而研究的出發(fā)點(diǎn)就是那一句“more modalities provide more information”

本文另一個(gè)好的想法是,把多模態(tài)之間的相關(guān)性窄锅,和模態(tài)各自的特性進(jìn)行分開考慮创千。本文認(rèn)為在捕獲特定于模式的信息以保護(hù)其屬性的同時(shí),開發(fā)多個(gè)模式之間的潛在相關(guān)性是至關(guān)重要的入偷。本文所提出的Hi-Net網(wǎng)絡(luò)分為三部分:模態(tài)特定網(wǎng)絡(luò)追驴,模態(tài)融合網(wǎng)絡(luò),和生成網(wǎng)絡(luò)疏之。其中 模態(tài)特定網(wǎng)絡(luò)主要思想是通過編碼器來(lái)學(xué)習(xí)各個(gè)模態(tài)的獨(dú)有的特征殿雪,融合網(wǎng)絡(luò)通過混合融合塊來(lái)實(shí)現(xiàn)( Mixed Fusion Block(MFB)),而生成網(wǎng)絡(luò)則通過GAN 來(lái)進(jìn)行訓(xùn)練锋爪。

本文主要貢獻(xiàn):

1 不同于現(xiàn)有的單一模態(tài)合成方法丙曙,我們提出了一種新的醫(yī)學(xué)圖像合成框架爸业,使用多種模態(tài)合成目標(biāo)模態(tài)圖像
2 我們的模型通過特定于模態(tài)的網(wǎng)絡(luò)捕獲各個(gè)模態(tài)特征,并利用多模態(tài)之間的相關(guān)性亏镰,使用分層多模態(tài)融合策略來(lái)有效地集成多模態(tài)多層次表示
3 提出了一種新的MFB模塊扯旷,自適應(yīng)地對(duì)不同融合策略進(jìn)行加權(quán),有效地提高了融合性能索抓。

總體網(wǎng)絡(luò)圖

圖1所示钧忽。用于多模態(tài)醫(yī)學(xué)圖像合成的Hi-Net框架。我們的Hi-Net包括三個(gè)主要部分:模態(tài)特定網(wǎng)絡(luò)逼肯、多模態(tài)融合網(wǎng)絡(luò)和多模態(tài)生成網(wǎng)絡(luò)耸黑。模態(tài)特定網(wǎng)絡(luò)用于學(xué)習(xí)模態(tài)特征,多模態(tài)融合網(wǎng)絡(luò)用于學(xué)習(xí)多模態(tài)之間的相互關(guān)系篮幢。多模態(tài)生成網(wǎng)絡(luò)由一個(gè)生成器和一個(gè)鑒別器組成大刊,其中生成器網(wǎng)絡(luò)對(duì)目標(biāo)圖像進(jìn)行生成,鑒別器的目的是對(duì)生成的圖像和真實(shí)的圖像進(jìn)行鑒別三椿。
模態(tài)特定網(wǎng)絡(luò)

模態(tài)特定網(wǎng)絡(luò)用來(lái)學(xué)習(xí)模態(tài)的高層特征缺菌。在圖1中為藍(lán)色部分。采用自動(dòng)編碼器結(jié)構(gòu)赋续。突然發(fā)現(xiàn)竟然不是Unet網(wǎng)絡(luò)男翰。通過L1重建損失約束另患。特定網(wǎng)絡(luò)仍然生成原來(lái)模態(tài)的圖像纽乱,L1損失能很好反映圖像強(qiáng)度變化。所以訓(xùn)練之后的特定網(wǎng)絡(luò)能夠在編碼階段學(xué)習(xí)到不同模態(tài)1和模態(tài)2的特定特征昆箕,并在解碼階段利用學(xué)習(xí)的特征重建和原圖相似的圖像鸦列。



值得注意的是:重構(gòu)損失提供了側(cè)輸出,以保證特定模態(tài)網(wǎng)絡(luò)對(duì)每個(gè)模態(tài)學(xué)習(xí)一個(gè)有區(qū)別的表示鹏倘,彼此獨(dú)立薯嗤。

多模態(tài)融合網(wǎng)絡(luò)

為了有效地利用來(lái)自不同模態(tài)不同層(如淺層和高層)特征表示的相關(guān)性,并減少不同模態(tài)之間的差異纤泵,我們提出了分層融合網(wǎng)絡(luò)骆姐。此外,還提出了一個(gè)MFB模塊捏题,以適應(yīng)權(quán)的不同輸入從不同的模式玻褪。
將每個(gè)特定模式網(wǎng)絡(luò)的第一池化層的特征表示輸入到第一個(gè)MFB塊中,第一個(gè)MFB塊輸出和特定網(wǎng)絡(luò)的第二層特征表示一起被輸入到下一個(gè)MFB模塊公荧,依次带射,在融合網(wǎng)絡(luò)中有三個(gè)MFB模塊,如圖1所示

值得注意的是:分層融合是獨(dú)立于模態(tài)特定網(wǎng)絡(luò)的循狰,他不會(huì)影響模態(tài)特定網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)的特征窟社,只是學(xué)習(xí)模態(tài)之間的潛在聯(lián)系券勺,另外所提出的分層融合是在不同的層進(jìn)行的,因此模型可以利用低層次和高級(jí)特征之間的多種模式之間的相關(guān)性

圖2為MFB模塊灿里,其中設(shè)計(jì)了自適應(yīng)權(quán)值網(wǎng)絡(luò)來(lái)融合來(lái)自多種模式的特征表示关炼。在多模式融合任務(wù)中,常用的策略有求和匣吊、求積和最大值盗扒。然而,對(duì)于不同的任務(wù)哪一種融合策略是最好的還不清楚缀去。因此侣灶,同時(shí)使用所有三種融合策略,然后將它們連接起來(lái)缕碎。然后褥影,添加一個(gè)卷積層conv1自適應(yīng)加權(quán)三個(gè)融合。如圖2所示咏雌。另外對(duì)于第一個(gè)融合快沒有Fn-1所以僅吧conv1的輸出輸入到conv2中凡怎。
多模態(tài)生成網(wǎng)絡(luò)

生成方式為傳統(tǒng)GAN的生成。約束為對(duì)抗損失加L1損失赊抖。




值得注意的是生成網(wǎng)絡(luò)使用了模態(tài)特定網(wǎng)絡(luò)中學(xué)習(xí)的不同層特征來(lái)盡可能的利用原始模態(tài)的信息统倒。

實(shí)驗(yàn)

使用multi-modal brain tumor segmentation challenge (BraTs2018)2018 數(shù)據(jù)集。本數(shù)據(jù)集包括285例多發(fā)性硬化癥患者氛雪。磁共振掃描來(lái)自19個(gè)不同的機(jī)構(gòu)房匆,包括膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)和低級(jí)別膠質(zhì)瘤(LGG)組。
患者掃描包含四種模態(tài):T1报亩、T1c浴鸿、T2和Flair。在本研究中弦追,使用T1, T2和F lair圖像來(lái)驗(yàn)證我們提出的合成方法的有效性岳链。使用2D軸平面切片




從表中可以看到MM-Syns方法比PIX2pix SSIM指標(biāo)要差點(diǎn)。這是不是也是一種不同模態(tài)特征表示之間的干擾導(dǎo)致的劲件,或許可以以后可以從減少這方面影響進(jìn)行以后的實(shí)驗(yàn)掸哑。

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市零远,隨后出現(xiàn)的幾起案子苗分,更是在濱河造成了極大的恐慌,老刑警劉巖遍烦,帶你破解...
    沈念sama閱讀 221,576評(píng)論 6 515
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件俭嘁,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異,居然都是意外死亡服猪,警方通過查閱死者的電腦和手機(jī)供填,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 94,515評(píng)論 3 399
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門拐云,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來(lái),“玉大人近她,你說(shuō)我怎么就攤上這事叉瘩。” “怎么了粘捎?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 168,017評(píng)論 0 360
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵薇缅,是天一觀的道長(zhǎng)。 經(jīng)常有香客問我攒磨,道長(zhǎng)泳桦,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 59,626評(píng)論 1 296
  • 正文 為了忘掉前任娩缰,我火速辦了婚禮灸撰,結(jié)果婚禮上,老公的妹妹穿的比我還像新娘拼坎。我一直安慰自己浮毯,他們只是感情好,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 68,625評(píng)論 6 397
  • 文/花漫 我一把揭開白布泰鸡。 她就那樣靜靜地躺著债蓝,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪盛龄。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上饰迹,一...
    開封第一講書人閱讀 52,255評(píng)論 1 308
  • 那天,我揣著相機(jī)與錄音讯嫂,去河邊找鬼蹦锋。 笑死,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛欧芽,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播葛圃,決...
    沈念sama閱讀 40,825評(píng)論 3 421
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼千扔,長(zhǎng)吁一口氣:“原來(lái)是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼!你這毒婦竟也來(lái)了库正?” 一聲冷哼從身側(cè)響起曲楚,我...
    開封第一講書人閱讀 39,729評(píng)論 0 276
  • 序言:老撾萬(wàn)榮一對(duì)情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎褥符,沒想到半個(gè)月后龙誊,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 46,271評(píng)論 1 320
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡喷楣,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 38,363評(píng)論 3 340
  • 正文 我和宋清朗相戀三年趟大,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了鹤树。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 40,498評(píng)論 1 352
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡逊朽,死狀恐怖罕伯,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情叽讳,我是刑警寧澤追他,帶...
    沈念sama閱讀 36,183評(píng)論 5 350
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站岛蚤,受9級(jí)特大地震影響邑狸,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜涤妒,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 41,867評(píng)論 3 333
  • 文/蒙蒙 一推溃、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧届腐,春花似錦铁坎、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 32,338評(píng)論 0 24
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)。三九已至围详,卻和暖如春朴乖,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背助赞。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 33,458評(píng)論 1 272
  • 我被黑心中介騙來(lái)泰國(guó)打工买羞, 沒想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人雹食。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 48,906評(píng)論 3 376
  • 正文 我出身青樓畜普,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親群叶。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子吃挑,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 45,507評(píng)論 2 359

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容