htseq實(shí)在太慢了轻庆，嘗試一下featureCounts
1.下載安裝
https://sourceforge.net/projects/subread/
或者
sudo apt install subread # 1.6.0 當(dāng)前最新版為1.6.4
conda subread
2.參數(shù)相關(guān)
featureCounts -h
annotation
2
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先試試水：
featureCounts -T 6 -p -a gencode.v29lift37.annotation.gtf -o f4.txt 4h.bam
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速度雖然沒有傳說的快，但也很厲害了懂鸵，看了一下可能限速的是硬盤，硬盤的使用率一直上不來套像，又要更新硬件了....
