原本計劃這一篇介紹基礎(chǔ)命令的刷喜，然后我們微課學(xué)院之前已經(jīng)有相關(guān)錄制好的視頻，而且網(wǎng)上的相關(guān)文章多不勝數(shù)立砸，因此也就不在賣弄了掖疮，簡單交流一下 Linux 入門過程中的幾個攔路虎，具體命令等在后文具體與到時候在詳細(xì)講解颗祝！
2. Linux 基礎(chǔ)知識
基因幫微課學(xué)院第一期的時候曾經(jīng)錄制過 Linux 基礎(chǔ)入門的視頻氮墨，點(diǎn)擊連接查看： Linux基本操作 。
Linux 系統(tǒng)中有這么一說：一切皆文件吐葵。
我們學(xué)習(xí) Linux 的時候要把這句話刻在骨子里规揪，這是 Linux 最基本的哲學(xué)诗鸭。直白的講就是疫粥，我們可以把 Linux 系統(tǒng)中所有的配置症革，軟件甚至硬件都可當(dāng)作文件對待贞言，是可查看轨香，可修改的忙菠。
基礎(chǔ)入門我們主要把習(xí)慣認(rèn)知上的幾個攔路虎掃除阎肝。更詳細(xì)的知識與信息則需要讀者各位花大量的時間學(xué)習(xí)練習(xí)改鲫！
首先是分區(qū)與路徑的認(rèn)知差別揖庄，windows 系統(tǒng)在國內(nèi)太普及了栗菜，所多人最開始接觸的也是簡單易用好上手的 windows 操作系統(tǒng)，所以在系統(tǒng)文件或者文件路徑的描述上是有比較大的區(qū)別： 在 windows 上我們一般習(xí)慣性的將硬盤分為 C/D/E 盤蹄梢，每個分區(qū)會有特定的盤符疙筹，而分區(qū)的名稱并不是那么重要；而在 linux 操作系統(tǒng)下禁炒，目錄系統(tǒng)是一個樹形結(jié)構(gòu)類似于下圖：
純手繪請勿噴而咆！
整個硬盤就是一個根目錄,一般用
/ 表示，在根目錄的基礎(chǔ)上又有一些其他目錄幕袱，比如我們放置配置文件的 /etc 目錄暴备，存放 第三方軟件的 /opt 目錄，存放二進(jìn)制程序的 /bin 目錄们豌，以及存放個人文件的 /home 目錄涯捻，等等。這個時候我們的分區(qū)就會以一個目錄的形式存在（將分區(qū)掛載在指定目錄下）望迎。
其次障癌，關(guān)于文件路徑的問題也是比較有意思的一塊，因?yàn)楹枚嗳藦?windows 遷移到 linux 下后就傻了擂煞。上一個問題我們了解了分區(qū)問題混弥，這個問題我們了解一下未分區(qū)下的文件及文件夾。比如在 D 盤下，我們有一個工作目錄: "WorkSpace",這個目錄下又有一個叫 “Scripts” 的文件夾蝗拿，里面存放了我們使用的一些腳本程序晾捏。windows 下表示方式為： D:\WorkSpace\Scripts. 而同樣的在 linux 系統(tǒng)下我們在 /home 目錄下也存在一個 WorkSpace 的工作目錄，里面也有一個我們存放腳本程序的文件夾 Scripts哀托， 我們就會這樣表示： /home/WorkSpace/Scripts惦辛。我們可以將 /home 理解為 D:\ 其他的直觀的區(qū)別就是 / 還是 \。 （撇 是斜杠仓手，捺 是反斜杠胖齐。linux 是斜杠青年， windows 是反斜杠青年嗽冒。哈哈~~~）
然后是字符編碼的問題呀伙，好多同學(xué)都有這么一傻：windows 下寫好的文檔在 linux 系統(tǒng)下打開就成為了亂碼，頓時就有點(diǎn)心浮氣躁添坊，手忙腳亂了剿另。其實(shí)這主要是字符編碼問題搞得鬼，windows 下中文一般默認(rèn)的是 GB2312 的編碼類型贬蛙，而在 linux 下一般默認(rèn)為 UTF-8 編碼類型雨女，因此當(dāng)出現(xiàn)亂碼的時候不要急手動調(diào)整一下編碼類型可能就柳暗花明又一村了！當(dāng)然為了避免這種麻煩的問題出現(xiàn)阳准， 一般推薦保存文本的時候直接選擇 UTF-8 編碼模式氛堕。
最后是關(guān)于命令行的問題，在 winowds 操作系統(tǒng)下野蝇，我們習(xí)慣拿鼠標(biāo) 點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)讼稚，哪里不服點(diǎn)哪里~ 但在 linux 系統(tǒng)下，想要跟有效率的工作就需要熟練使用 命令行浪耘。關(guān)于命令的詳細(xì)講解乱灵，推薦一個網(wǎng)站： Linux 命令大全 自行查閱練習(xí)！
先做一個簡單的梳理七冲，生物信息學(xué)分析過程中，我們主要都是針對文件以及目錄（文件夾）進(jìn)行操作的规婆。主要涉及到了以下的命令：
ls 查看 目錄下的文件
cd 切換 目錄
cat 查看 文件內(nèi)容（針對小文件）
less 查看 文件內(nèi)容（針對大文件）
more 查看 文件內(nèi)容
touch 創(chuàng)建 文件
mkdir 創(chuàng)建 文件夾
rm 刪除 文件或者文件夾
rmdir 刪除 文件夾
cp 復(fù)制 文件/文件夾
mv 重命名/移動 文件/文件夾
chmod 改變文件/文件夾權(quán)限
今天主要學(xué)習(xí) ls 命令.
ls 命令主要是用來列出 文件目錄的澜躺，即列出指定的文件夾下或者當(dāng)前文件夾下的目錄列表，使用頻率相當(dāng)高抒蚜。
查看 ls的主要用法可以使用命令： man ls
顯示如下：
這是 ls 的幫助說明文檔掘鄙，顯示了 ls 的詳細(xì)參數(shù)說明。
具體用法實(shí)例詳見網(wǎng)頁 ls 詳解,不做贅述免得有抄襲別人的嫌疑嗡髓！
其他命令的學(xué)習(xí)也可以用一樣的學(xué)習(xí)模式學(xué)習(xí)了解操漠。
歡迎關(guān)注基因幫，關(guān)注小劉哥！
