歷史推薦匯總：
2019年共推薦81篇單細(xì)胞領(lǐng)域高分文章（單細(xì)胞文獻(xiàn)速遞81篇·再見2019)贯钩。
2020年1-3月供推薦56篇單細(xì)胞領(lǐng)域高分文章（2020年一季度·單細(xì)胞文獻(xiàn)速遞56篇）
序號(hào)：2020-119
編者按：
SRT技術(shù)為我們提供了一個(gè)全新的認(rèn)識(shí)細(xì)胞的角度——從轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)（TFBS）來解讀細(xì)胞異質(zhì)性以及細(xì)胞狀態(tài)轉(zhuǎn)變。
自報(bào)告轉(zhuǎn)座子（SRT）可以同時(shí)讀取單細(xì)胞中的基因表達(dá)和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的信息
【文獻(xiàn)類別】技術(shù)方法-自報(bào)告轉(zhuǎn)座子
【發(fā)表期刊】Cell
【影響因子】 38.6
【發(fā)表時(shí)間】2020-07-18
【PMID】32710817
【文章摘要】細(xì)胞的異質(zhì)性混淆了轉(zhuǎn)錄因子（TF）結(jié)合的原位測(cè)定祸穷。單細(xì)胞RNA測(cè)序是通過基因表達(dá)對(duì)細(xì)胞類型進(jìn)行分解歸類，但卻沒有任何技術(shù)能將細(xì)胞類型與其轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)聯(lián)系在一起雷滚。因此吗坚，研究人員提出了一種全新的技術(shù)——將自報(bào)告轉(zhuǎn)座子（self-reporting transposons, SRTs）作為單細(xì)胞名片（scCC）呆万，可同時(shí)檢測(cè)單細(xì)胞中的基因表達(dá)以及繪制轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)（TFBS）车份。他們首先從mRNA中獲取SRTs的基因組位置，并利用SRTs會(huì)與外源TF-轉(zhuǎn)座酶進(jìn)行融合并沉淀這一特性來定位TFBS出爹。緊接著缎除，研究人員介紹了scCC，它可以從scRNA-seq庫(kù)中定位SRTs器罐，并由此在同一批細(xì)胞中同時(shí)識(shí)別細(xì)胞類型和TFBS。研究人員還利用此技術(shù)對(duì)多個(gè)TF進(jìn)行了基準(zhǔn)測(cè)試抖誉。接下來他們利用scCC發(fā)現(xiàn)了K562細(xì)胞中由BRD4介導(dǎo)的細(xì)胞狀態(tài)轉(zhuǎn)變。最后袒炉，研究人員使用scCC技術(shù)在單細(xì)胞分辨率上繪制了小鼠皮層的BRD4結(jié)合位點(diǎn)的圖譜樊零，建立了原位研究TF生物學(xué)的新方式。
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