從接觸計(jì)算機(jī)之后磅网，大多數(shù)學(xué)習(xí)工作的時(shí)候谈截，我們用的最多的就是Office辦公軟件了，每一篇論文的誕生離不開word文檔涧偷，每一次匯報(bào)離不開ppt簸喂，甚至無數(shù)的數(shù)據(jù)也都經(jīng)過excel得來。學(xué)習(xí)了一段時(shí)間的R燎潮，慢慢感受著它的強(qiáng)大喻鳄，而從學(xué)習(xí)到應(yīng)用還是一段很漫長(zhǎng)的路，而且是一段披荊斬棘的路确封。從學(xué)習(xí)敲代碼到練習(xí)做項(xiàng)目除呵，還是一條很長(zhǎng)的路，而此刻的我感覺已經(jīng)走了很漫長(zhǎng)的一段平路要開始爬坡了爪喘。今天就來記錄一下這兩天一個(gè)數(shù)據(jù)篩選讓我學(xué)習(xí)到的東西竿奏，以及為什么開始嫌棄office了。
不得不說腥放，當(dāng)我第一次拿到轉(zhuǎn)錄組差異基因大表時(shí)泛啸，篩選差異基因我還是用的excel，那時(shí)候還佩服excel的if判斷挺實(shí)用秃症，一句話可以篩一列候址，以前傻傻做加減號(hào)甚至目測(cè)曬數(shù)據(jù)的時(shí)代終于過去。學(xué)了一段時(shí)間R這次拿到新表种柑，我決定用R試一試岗仑，不試不知道，一試就愛上了它聚请，雖然這個(gè)愛來的也有些不容易荠雕。
接觸了R也有幾個(gè)月，不過也都是停留在練習(xí)講義里的代碼驶赏，照葫蘆畫瓢的做練習(xí)題上炸卑。真正要按自己的意愿去做東西時(shí)，還是發(fā)現(xiàn)無從下手煤傍，就像我們學(xué)了那么多年英語盖文，遇到一個(gè)老外還發(fā)現(xiàn)自己不知道怎么張口一樣。還好蚯姆，這是一場(chǎng)開卷考試五续，不會(huì)的我們可以查講義洒敏，問google（來了國(guó)外大多數(shù)時(shí)間我也已經(jīng)放棄了度娘），還有隨時(shí)不懂可以請(qǐng)教的小師妹和熱心的群友疙驾，所以困難一下子小了很多凶伙。也在一個(gè)下午那小數(shù)據(jù)組織代碼，舊數(shù)據(jù)測(cè)試它碎，最后做自己的數(shù)據(jù)分析镊靴。可能這就是一個(gè)簡(jiǎn)單的生信學(xué)習(xí)分析路徑吧链韭。雖然解決的是很簡(jiǎn)單的問題偏竟，但是還是有那么一絲小小的成就感。
其實(shí)我做的事情很簡(jiǎn)單敞峭，就是提取了有注釋的est踊谋，然后去除了幾組TPM全為0的值，然后按一定條件篩選了差異基因旋讹，畫了一個(gè)韋恩圖殖蚕。這一切，office完全可以搞定沉迹。比如可以通過excel利用排序和if判斷睦疫，提取想要的信息和做篩選，這些我都手把手做過鞭呕，韋恩圖ppt畫幾個(gè)圈圈就可以搞定蛤育。如今接觸了R之后，頓時(shí)覺得好嘲笑剛?cè)雽W(xué)的自己葫松，花了好幾周傻乎乎的在那眼篩近萬個(gè)EST瓦糕，眼睛要瞎一不留神還出錯(cuò)從頭來。所以當(dāng)時(shí)師弟說的很有道理腋么，學(xué)生信的人要懶一點(diǎn)才好咕娄，因?yàn)樗麄儾挪粫?huì)愿意花大把的功夫做無聊的重復(fù)工作，總會(huì)想出辦法解決來珊擂，那就是用最短的語言來解決重復(fù)的工作圣勒。如今R就做到了，所以有些時(shí)候勤奮是一方面摧扇，更多的時(shí)候還得用腦子圣贸。就像我花了一個(gè)下午的功夫，雖然也可以用來完成這個(gè)篩選的工作扳剿，但是我建立了一套方便自己使用的篩選代碼旁趟，以后新數(shù)據(jù)來了只需要做簡(jiǎn)單的修改昼激，直接點(diǎn)run就OK了庇绽，這種付出會(huì)覺得很值得锡搜。
因?yàn)橛辛薳xcel和R的比較，我也發(fā)現(xiàn)了excel的一些問題瞧掺，比如用以上兩者我得到的結(jié)果有出入耕餐，于是我就在這些出入中找問題，最終發(fā)現(xiàn)excel處理的數(shù)據(jù)是有限的辟狈，E-310以上的數(shù)據(jù)它就工作不了了肠缔，而R完全不會(huì)有這個(gè)問題。作圖R更是占優(yōu)勢(shì)哼转，如果用ppt做韋恩圖明未，花功夫又low不說，得到的圖的質(zhì)量也很有限壹蔓。而R一行代碼可輸出各種格式的韋恩圖趟妥，而且這行代碼還可以反復(fù)使用。所以佣蓉，嘗到了甜頭披摄，更覺得自己應(yīng)該好好學(xué)習(xí)下去。要知難而上勇凭，走過最坎坷的這段瓶頸期疚膊，期待未來的技術(shù)指數(shù)增長(zhǎng)。
【生信小記2018-07-13】學(xué)以致用的小小成就感
最后編輯于 ：
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
- 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門美澳，熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來销部，“玉大人，你說我怎么就攤上這事制跟【俗” “怎么了？”我有些...
- 文/不壞的土叔 我叫張陵雨膨，是天一觀的道長(zhǎng)擂涛。 經(jīng)常有香客問我，道長(zhǎng)聊记，這世上最難降的妖魔是什么撒妈？ 我笑而不...
- 正文 為了忘掉前任恢暖，我火速辦了婚禮，結(jié)果婚禮上狰右，老公的妹妹穿的比我還像新娘杰捂。我一直安慰自己，他們只是感情好棋蚌，可當(dāng)我...
- 文/花漫 我一把揭開白布嫁佳。 她就那樣靜靜地躺著，像睡著了一般谷暮。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪蒿往。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上，一...
- 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼娃惯，長(zhǎng)吁一口氣：“原來是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼！你這毒婦竟也來了肥败？” 一聲冷哼從身側(cè)響起趾浅，我...
- 序言：老撾萬榮一對(duì)情侶失蹤，失蹤者是張志新（化名）和其女友劉穎馒稍，沒想到半個(gè)月后皿哨，有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體，經(jīng)...
- 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡纽谒，尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
- 正文 我和宋清朗相戀三年证膨，在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片鼓黔。...
- 正文 年R本政府宣布缎谷，位于F島的核電站井濒，受9級(jí)特大地震影響，放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜瑞你，卻給世界環(huán)境...
- 文/蒙蒙 一酪惭、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧捏悬，春花似錦撞蚕、人聲如沸润梯。這莊子的主人今日做“春日...
- 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽纺铭。三九已至寇钉，卻和暖如春，著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間舶赔，已是汗流浹背扫倡。 一陣腳步聲響...
- 正文 我出身青樓，卻偏偏與公主長(zhǎng)得像锥累，于是被迫代替她去往敵國(guó)和親缘挑。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子，可洞房花燭夜當(dāng)晚...
