分子實(shí)驗(yàn)的常規(guī)檢測(cè)內(nèi)容除了基因就是蛋白啦域那,ELISA、WB猜煮、免疫組化...理論知識(shí)很扎實(shí)次员,可是實(shí)驗(yàn)結(jié)果卻很扎心,比如WB王带,條帶總是那么不正常淑蔚,要么沒有,要么彌散辫秧,要么非特異束倍。有沒有不用做實(shí)驗(yàn)就可以完成蛋白驗(yàn)證的方法被丧?
有盟戏,人類蛋白圖譜(HPA)數(shù)據(jù)庫用起來。
HPA是人類組織和細(xì)胞中蛋白質(zhì)空間分布最大甥桂、最全面的數(shù)據(jù)庫柿究。其利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),從RNA和蛋白水平研究人類不同組織和器官中的蛋白表達(dá)情況蝇摸,包括超過1000萬張顯示單個(gè)細(xì)胞水平上蛋白表達(dá)模式的圖像貌夕。
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以CD36為例,看看能搜到哪些結(jié)果之宿?
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下載功能:搜索頁面上列出的與當(dāng)前搜索結(jié)果對(duì)應(yīng)的基因數(shù)據(jù)可以不同格式下載弧呐,包括XML俘枫、RDF和TAB。HPA還提供多種可下載文件鸠蚪,其中包括來自組織、病理學(xué)和細(xì)胞圖譜的完整原始蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)盾舌,以及組織和細(xì)胞中RNA的表達(dá)數(shù)據(jù)汹押。所有可下載的文件均通過如下鏈接獲取:www.proteinatlas.org/about/download。
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參考文獻(xiàn)
Thul PJ, Lindskog C. The human protein atlas: A spatial map of the human proteome. Protein Sci. 2018 Jan;27(1):233-244. doi: 10.1002/pro.3307. Epub 2017 Oct 10. PMID: 28940711; PMCID: PMC5734309.
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