不做WB或免疫組化帆吻,也能輕松完成蛋白驗(yàn)證 | 蛋白組數(shù)據(jù)庫推薦

分子實(shí)驗(yàn)的常規(guī)檢測(cè)內(nèi)容除了基因就是蛋白啦域那,ELISA、WB猜煮、免疫組化...理論知識(shí)很扎實(shí)次员,可是實(shí)驗(yàn)結(jié)果卻很扎心,比如WB王带,條帶總是那么不正常淑蔚,要么沒有,要么彌散辫秧,要么非特異束倍。有沒有不用做實(shí)驗(yàn)就可以完成蛋白驗(yàn)證的方法被丧?

有盟戏,人類蛋白圖譜(HPA)數(shù)據(jù)庫用起來。

HPA是人類組織和細(xì)胞中蛋白質(zhì)空間分布最大甥桂、最全面的數(shù)據(jù)庫柿究。其利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),從RNA和蛋白水平研究人類不同組織和器官中的蛋白表達(dá)情況蝇摸,包括超過1000萬張顯示單個(gè)細(xì)胞水平上蛋白表達(dá)模式的圖像貌夕。


如何使用HPA民镜?

HPA為用戶提供搜索、瀏覽及下載功能们童。

搜索功能

用戶可使用簡單搜索或高級(jí)搜索在首頁搜索框中輸入關(guān)鍵詞慧库,例如基因名馋嗜、基因描述、外部基因/蛋白質(zhì)標(biāo)識(shí)符(UniProt听皿,Ensembl宽档,NCBI Entrez基因)吗冤、抗體標(biāo)識(shí)符和圖像標(biāo)注等,得到目標(biāo)基因/蛋白在組織覆致、器官煌妈、細(xì)胞中的表達(dá)情況宣羊。

以CD36為例,看看能搜到哪些結(jié)果之宿?

搜索功能操作示例


搜索結(jié)果展示

搜索結(jié)果梗概


轉(zhuǎn)錄水平上,基因在人體不同樣本中的表達(dá)情況


提供蛋白編碼基因在不同組織中的表達(dá)情況


提供蛋白編碼基因在人/小鼠大腦中的表達(dá)情況


提供蛋白編碼基因在不同細(xì)胞系中的表達(dá)情況,同時(shí)還體現(xiàn)了對(duì)應(yīng)的亞細(xì)胞定位信息


提供蛋白編碼基因在不同血液細(xì)胞類型中的表達(dá)情況


提供基因在腫瘤組織中的表達(dá)情況尺迂、生存分析和病理學(xué)圖像等結(jié)果


提供基因枪狂、蛋白以及抗體驗(yàn)證圖像的詳細(xì)信息


瀏覽功能

用戶可直接點(diǎn)擊進(jìn)入TISSUE ALTAS州疾、CELL ALTAS皇拣、PATHOLOGY ALTAS薄嫡、BRAIN ALTAS毫深、BLOOD ALTAS和METABLIC ATLAS瀏覽單個(gè)組織或細(xì)胞器的蛋白質(zhì)組信息毒姨。

瀏覽功能入口


下載功能:搜索頁面上列出的與當(dāng)前搜索結(jié)果對(duì)應(yīng)的基因數(shù)據(jù)可以不同格式下載弧呐,包括XML俘枫、RDF和TAB。HPA還提供多種可下載文件鸠蚪,其中包括來自組織、病理學(xué)和細(xì)胞圖譜的完整原始蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)盾舌,以及組織和細(xì)胞中RNA的表達(dá)數(shù)據(jù)汹押。所有可下載的文件均通過如下鏈接獲取:www.proteinatlas.org/about/download。

下載頁面


HPA訪問地址:https://www.proteinatlas.org/??


首發(fā)公號(hào):國家基因庫大數(shù)據(jù)平臺(tái)??

參考文獻(xiàn)

Thul PJ, Lindskog C. The human protein atlas: A spatial map of the human proteome. Protein Sci. 2018 Jan;27(1):233-244. doi: 10.1002/pro.3307. Epub 2017 Oct 10. PMID: 28940711; PMCID: PMC5734309.

圖片來源于HPA官網(wǎng)和參考文獻(xiàn)妙痹,如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系刪除怯伊。

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末耿芹,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市挪哄,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌砸彬,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 217,277評(píng)論 6 503
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件蛀蜜,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異滴某,居然都是意外死亡滋迈,警方通過查閱死者的電腦和手機(jī),發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 92,689評(píng)論 3 393
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門椰憋,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來橙依,“玉大人硕旗,你說我怎么就攤上這事漆枚。” “怎么了软族?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 163,624評(píng)論 0 353
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵残制,是天一觀的道長。 經(jīng)常有香客問我初茶,道長,這世上最難降的妖魔是什么螺戳? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 58,356評(píng)論 1 293
  • 正文 為了忘掉前任倔幼,我火速辦了婚禮,結(jié)果婚禮上凤藏,老公的妹妹穿的比我還像新娘。我一直安慰自己揖庄,他們只是感情好,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 67,402評(píng)論 6 392
  • 文/花漫 我一把揭開白布疙筹。 她就那樣靜靜地躺著而咆,像睡著了一般幕袱。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上涯捻,一...
    開封第一講書人閱讀 51,292評(píng)論 1 301
  • 那天望迎,我揣著相機(jī)與錄音,去河邊找鬼涛浙。 笑死轿亮,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛蒿涎,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播劳秋,決...
    沈念sama閱讀 40,135評(píng)論 3 418
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼,長吁一口氣:“原來是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼呀伙!你這毒婦竟也來了?” 一聲冷哼從身側(cè)響起箫锤,我...
    開封第一講書人閱讀 38,992評(píng)論 0 275
  • 序言:老撾萬榮一對(duì)情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎谚攒,沒想到半個(gè)月后馏臭,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 45,429評(píng)論 1 314
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡绕沈,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 37,636評(píng)論 3 334
  • 正文 我和宋清朗相戀三年乍狐,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了浅蚪。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片抒蚜。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,785評(píng)論 1 348
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡嗡髓,死狀恐怖,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出饿这,到底是詐尸還是另有隱情,我是刑警寧澤嚣鄙,帶...
    沈念sama閱讀 35,492評(píng)論 5 345
  • 正文 年R本政府宣布串结,位于F島的核電站,受9級(jí)特大地震影響卧蜓,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏弥奸。R本人自食惡果不足惜,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 41,092評(píng)論 3 328
  • 文/蒙蒙 一盛霎、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧愤炸,春花似錦、人聲如沸横侦。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 31,723評(píng)論 0 22
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至翼虫,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間珍剑,已是汗流浹背招拙。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 32,858評(píng)論 1 269
  • 我被黑心中介騙來泰國打工别凤, 沒想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人规哪。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 47,891評(píng)論 2 370
  • 正文 我出身青樓诉稍,卻偏偏與公主長得像均唉,于是被迫代替她去往敵國和親。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 44,713評(píng)論 2 354

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容