ImageJ 作為一款強(qiáng)大的圖像處理軟件,其介紹在這里不做贅述抡秆。
FIJI 是一個(gè)圖像處理軟件包——ImageJ的含大量插件的發(fā)行版奕巍,便于科學(xué)圖像分析。
本文主要介紹利用FIJI圈定巖石薄片背散射照片礦物邊界儒士,統(tǒng)計(jì)各礦物面積的止,計(jì)算礦物面積比例,獲得礦物擬合長(zhǎng)短軸及方位着撩。
一诅福、軟件下載
FIJI(ImageJ、ImageJ2)下載地址:https://imagej.net/
推薦使用Fiji拖叙,該版本包含眾多插件氓润,使用較方便。
二薯鳍、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
準(zhǔn)備已拼接完整的巖石薄片背散射照片咖气,如圖1。
三辐啄、圖片處理
3.1 圖片導(dǎo)入
File > Open 選擇照片采章,并轉(zhuǎn)化為8-bit。
3.2 平滑去噪
原始的背散射照片存在許多局部不平滑和噪點(diǎn)壶辜,Process > Smooth操作可使照片表面更光滑悯舟,Process > Noise > Despeckle操作可以有效減少照片的噪點(diǎn)。
平滑去噪前 | 平滑去噪后 |
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圖5
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圖6
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3.3 設(shè)置閾值
通過(guò)觀察可以發(fā)現(xiàn)砸民,不同礦物在照片中所顯示的顏色不盡相同(即柵格灰度值不同)抵怎。因此,可以通過(guò)設(shè)置照片顯示的閾值來(lái)分離各類礦物岭参。(下面以灰色礦物(長(zhǎng)石)為例進(jìn)行介紹)
①Image > Adjust > Threshold 出現(xiàn)Threshold窗口
②調(diào)節(jié)閾值上下限反惕,使得照片僅出現(xiàn)長(zhǎng)石區(qū)域(紅色),Threshold窗口左右箭頭可進(jìn)行微調(diào)
③Apply演侯,出現(xiàn)圖11姿染,Process > Noise > Despeckle 去噪處理,可重復(fù)操作去噪秒际,直到滿意為止悬赏,圖12。
去噪前 | 去噪后 |
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圖11
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圖12
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④圖12中仍然存在許多不理想的臟區(qū)娄徊,可進(jìn)行濾波(如Process > Filter > Gaussian Blur)闽颇、二值/邊緣擦除/邊緣擴(kuò)大/填空(Process > Binary > Make Binary/Erode/Dilate/Fill Holes)、去噪(Process > Noise > Despeckle )等交替重復(fù)操作寄锐,最終使得照片處理結(jié)果滿足預(yù)期 圖14兵多。
去噪前 | 去噪后 |
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圖13
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圖14
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3.4 礦物總面積統(tǒng)計(jì)
Analyze > Measure (圖15)即可獲得長(zhǎng)石礦物的總面積(圖16)尖啡。Analyze > Set Measurements 設(shè)置測(cè)量結(jié)果的各選項(xiàng)(圖17)如可設(shè)置Fit Ellipse表示計(jì)算擬合橢圓的參數(shù)(長(zhǎng)軸、短軸剩膘、方位等)衅斩。
3.5 礦物邊界圈定、各礦物顆粒面積
Analyze > Analyze Particles (圖18怠褐、19)可自動(dòng)圈定長(zhǎng)石各顆粒的邊界矛渴。Analyze Particles 彈窗上Size為處理的顆粒面積閾值,0-Infinity為處理所有大小的顆粒惫搏,可自行設(shè)置處理范圍(如10-20具温,表示處理面積在10-20之間的顆粒,其余面積大小的顆粒不做處理)筐赔,Circularity默認(rèn)铣猩,Show下拉框可選擇邊界(圖21)、擬合橢圓茴丰、掩膜等(圖20)达皿。下面的選項(xiàng)可根據(jù)需要勾選,如Add to Manager可將獲得的礦物顆粒邊界添加到ROI Manager(圖22)贿肩,方便后面修改顆粒邊界峦椰;Exclude on edges 選項(xiàng)表示排除圖片邊界的顆粒。
邊界 | 邊界 |
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圖22
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圖23
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