導讀：大腦是人體最為復雜的器官之一，由多個功能特化的腦區(qū)構成。每個腦區(qū)承擔著特定的生理和認知功能照瘾。通過應用定量數據映射技術涩拙，將數值以色彩編碼的形式呈現(xiàn)于各個腦區(qū)际长，可以顯著增強對不同腦區(qū)定量信息的視覺識別和理解。
《bioRxiv》文章“Multifaceted impact of specialized neuropeptide-intensive neurons on
the selective vulnerability in Alzheimer’s disease”fig 3A的大腦腦區(qū)切面圖（medical sagittal view）展示了隨著年齡的增長兴泥，阿爾茨海默病相關神經肽（Alzheimer’s disease-associated neuropeptides工育，ADNPs）在4個腦區(qū)中表達降低。AMY：杏仁核（amygdala）搓彻，CNG：前扣帶腦皮質（anterior cingulate cortex）如绸，HIP：海馬體（hippocampus），BA9：前額葉皮層9（Frontal cortex 9）。
主要的大腦腦區(qū)及其功能
前額葉（Frontal Lobes）：
負責高級認知功能，如決策栅贴、規(guī)劃抹凳、注意力、個性和社交行為
運動和語言功能也部分位于此區(qū)域宴抚。
頂葉（Parietal Lobes）：
處理觸覺和本體感覺（身體各部分的位置和運動）
參與空間感知和視覺信息的處理。
顳葉（Temporal Lobes）：
與聽覺處理、語言理解和記憶形成有關谎势。
顳葉的海馬體是長期記憶形成的關鍵區(qū)域。
枕葉（Occipital Lobes）：
主要負責視覺信息的處理
島葉（Insula）：
與內臟感覺和情緒處理有關杨名。
扣帶回（Cingulate Cortex）：
參與情緒脏榆、注意力和疼痛感知
基底神經節(jié)（Basal Ganglia）：
控制運動和協(xié)調
小腦（Cerebellum）：
協(xié)調運動和維持身體平衡
下丘腦（Hypothalamus）：
調節(jié)體溫、食欲台谍、睡眠和內分泌系統(tǒng)
腦干（Brainstem）：
連接大腦和脊髓须喂，控制呼吸、心跳等基本生命功能
這些腦區(qū)通過復雜的神經網絡相互連接趁蕊，共同協(xié)作坞生，使大腦能夠執(zhí)行其復雜的功能。每個腦區(qū)都包含大量的神經元掷伙，它們通過電信號和化學信號相互溝通是己。
1，打開作圖URL
https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_cerebro_colormap_115
2任柜，示例數據
點擊圖片上方的示例數據卒废，下載沛厨，并使用excel打開。
示例數據包括2列：
第1列是腦區(qū)縮寫摔认。必需來自示例excel第二個sheet第一列所給的30個腦區(qū)名逆皮。
第2列是各個腦區(qū)的數值。若輸入多列數值参袱，則會展示多個圖电谣。
3，輸入檢查
示例數據：點擊輸入框下面的“示例”按鈕抹蚀，將載入示例數據辰企。
真實數據：數據放在excel中，調整好后况鸣，Ctrl+A選中數據牢贸，Ctrl+C拷貝，Ctrl+V粘貼數據到輸入框中镐捧。
然后使用輸入框下面的“輸入檢查”按鈕先對輸入數據進行檢查潜索。若檢查不通過，請根據檢查提示重復【修改-輸入檢查】步驟懂酱，直到檢查通過（如下圖所示）竹习，然后可以繼續(xù)選擇參數。
注：輸入檢查是新加功能列牺，它會根據不同模塊的輸入要求整陌，逐行逐列檢查輸入數據，并給出提示瞎领，確保數據符合模塊輸入要求泌辫。
4，選擇參數
顏色：設置了低中高三種顏色九默。低的數值以綠色表示震放，高的數值的紅色表示，中間的值以黃色表示驼修。漸變顏色
是否繪制legend color：是否繪制代表數值的顏色條
是否繪制樣品名：僅一列數值時殿遂，可以選擇不繪制。多列數值時乙各，選擇繪制
是否標注各個腦區(qū)名字：是否以箭頭的形式標注感興趣腦區(qū)的名字縮寫墨礁。
字體：設置了期刊雜志中最常用的兩種字體：Times New Roman和Arial。如需使用其他字體耳峦，可以下載pdf或者svg圖片恩静，然后使用acrobat illustrator進行替換或者添加文字
5，提交出圖
檢查通過妇萄，并且參數選好后蜕企，點擊“提交”按鈕，約3s后冠句，會在頁面上顯示彩色的腦區(qū)圖轻掩。我們提供了pdf、svg兩種矢量圖懦底，600 dpi的png標量圖供大家下載使用唇牧。可以使用acrobat illustrator等軟件編輯矢量圖聚唐，進行組圖丐重，調整文字位置，添加說明等操作杆查，以滿足個性化需求扮惦。
結果說明：該圖為數據映射到exterior（大腦表面）的視圖，同時提供了數據映射到sagittal（切面）的視圖（見最后一張圖）亲桦。
如果選擇標注名字并且有多列樣品的數值崖蜜，則會同時以兩種視圖方式繪制多張圖片，colorbar范圍根據所有列數值范圍設定客峭。
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