學(xué)習(xí)小組Day5筆記--單眾

思維導(dǎo)圖

day5思維導(dǎo)圖.png

學(xué)習(xí)要點----R語言重要的兩個數(shù)據(jù)類型

part 1:向量

向量:多個元素組成的變量

理解元素喇喉、向量和標(biāo)量-來自生信星球

幾種賦值向量的方法
a <- c(1, 2, 3) #常用的向量定義寫法,意為將x定義為由元素1校坑,2轧飞,3組成的向量衅鹿。
a <- (1: 10) #從1-10之間所有的整數(shù)
a <- seq(1, 10, by = 0.5) #1-10之間每隔0.5取一個數(shù)(注意這里是逗號不是分號)
a <- rep(1: 3, times = 2) #1-3 重復(fù)2次

從向量中提取元素

根據(jù)元素位置
x[4] #x第4個元素
x[-4] #排除法,除了第4個元素之外剩余的元素
x[2: 4] #第2到4個元素
x[-(2:4)] #除了……
x[c(1, 5)] #第1個和第5個元素

根據(jù)值的大小
x[x == 10] #等于10的元素
x[x < 0]
x[x %in% c(1, 2, 5)] #存在于向量c(1过咬,2大渤,5)中的元素

注:x[x %in% c(1, 2, 5)]也可以簡單理解為c在x中的真子集。

part 2:數(shù)據(jù)框

(1)讀取本地數(shù)據(jù)
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)
讀取文件掸绞,分隔符為Tab泵三,有表頭
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)
把這個數(shù)據(jù)框賦給一個變量a

(2)設(shè)置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例數(shù)據(jù)里有doudou.txt 注意這里的變量X是一個數(shù)據(jù)框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默認值的行名就是行號,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回數(shù)據(jù)衔掸,左上角第一格為空烫幕,R會自動補為x,用這個命令來修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列為行名

(3)數(shù)據(jù)框的導(dǎo)出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改為逗號,字符串不加雙引號(默認格式帶由雙引號)

(4)變量的保存與重新加載
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存當(dāng)前所有變量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一個變量
load("frame1.RData")#再次使用RData時的加載命令
保存的格式是RData敞映。

(5)提取元素
X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列
X[y] #第y列
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列

(6)直接使用數(shù)據(jù)框中的變量
例:提取兩列作散點圖
c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50))
> plot(c$case,c$values)

其他方法:
方法一 attach
attach(c)
plot(case,values)

方法二 with
with(c,{
+ plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并賦值給x,<<的意思是作為全局變量较曼,y也就是出了with循環(huán)仍有效。
})
x#運行完后打印x

學(xué)習(xí)體會

Day5的學(xué)習(xí)著實費勁一些振愿,又生病捷犹,真是沒愛了。還有兩天冕末,爭取多學(xué)一點萍歉,畢竟這幾天不用像之前那樣天天摸瞎了。

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