R語言ggstatsplot包做卡方檢驗(yàn)

library(ggstatsplot)
library(ggplot2)
library(dplyr)
data("diamonds")

diamonds2 <- diamonds %>% 
  filter(color == c('J', 'H', 'F'), clarity %in% c('SI2', 'VS1', 'IF'))#篩選出diamonds中顏色為J喳张、H、F镀裤,清晰度為SI2穷当、VS1、IF的數(shù)據(jù)淹禾,并保存為diamonds2馁菜。

ggbarstats(diamonds2, color, clarity, palette = 'Set2')
#以下為統(tǒng)計(jì)結(jié)果
Note: 95% CI for effect size estimate was computed with 100 bootstrap samples.
Note: Results from one-sample proportion tests for each level of the variable
clarity testing for equal proportions of the variable color.

# A tibble: 3 x 9
  condition N          F      H      J      `Chi-squared`    df `p-value` significance
  <ord>     <chr>      <chr>  <chr>  <chr>          <dbl> <dbl>     <dbl> <chr>       
1 SI2       (n = 1208) 45.20% 41.72% 13.08%         225.      2         0 ***         
2 VS1       (n = 966)  46.38% 38.20% 15.42%         149.      2         0 ***         
3 IF        (n = 251)  53.39% 39.44% 7.17%           84.6     2         0 ***   
image.png
-如圖所示,卡方值為15.01铃岔,p = 0.005 < 檢驗(yàn)水準(zhǔn)0.05汪疮,可認(rèn)為鉆石的顏色與分類不獨(dú)立,即存在關(guān)聯(lián)毁习。
-各個(gè)clarity的組內(nèi)比較智嚷,不同顏色鉆石的數(shù)量的差異均具有顯著性(每個(gè)柱子上面為三顆星“*”,卡方值分別為225纺且, 149盏道, 84.6,均大于卡方分布在自由度為2载碌,α為0.05時(shí)的值5.99猜嘱,即p < 0.05, 所以都具有顯著性)。
ggpiestats(diamonds2, color, clarity, palette = 'Set3')
#以下為統(tǒng)計(jì)結(jié)果
Note: 95% CI for effect size estimate was computed with 100 bootstrap samples.

Note: Results from one-sample proportion tests for each level of the variable
clarity testing for equal proportions of the variable color.

# A tibble: 3 x 9
  condition N          F      H      J      `Chi-squared`    df `p-value` significance
  <ord>     <chr>      <chr>  <chr>  <chr>          <dbl> <dbl>     <dbl> <chr>       
1 SI2       (n = 1208) 45.20% 41.72% 13.08%         225.      2         0 ***         
2 VS1       (n = 966)  46.38% 38.20% 15.42%         149.      2         0 ***         
3 IF        (n = 251)  53.39% 39.44% 7.17%           84.6     2         0 ***         
image.png
-此圖統(tǒng)計(jì)結(jié)果與上面柱狀圖的結(jié)果一樣嫁艇,只是將柱狀圖換成餅圖朗伶。
-這種些圖形能夠方便快速的將統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)快速可視化,不僅能得到基本的卡方統(tǒng)計(jì)量步咪,P值论皆,還可以得到各分組內(nèi)的分布狀況,如顏色為J的鉆石在分類為SI2的組內(nèi)占比為13%猾漫,占比最大的為顏色F点晴,占比45%。在分類VS1和IF組內(nèi)悯周,占比最大的也是顏色F粒督,分別占比46%和53%。
grouped_ggpiestats(diamonds2[diamonds2$cut != 'Very Good',], color, clarity, grouping.var = cut, simulate.p.value = T)  #diamonds2[diamonds2$cut != 'Very Good',]表示去掉數(shù)據(jù)中cut為Very Good的數(shù)據(jù)队橙,simulate.p.value = T表示對(duì)P值進(jìn)行調(diào)整坠陈,因?yàn)閏ut為Fair的數(shù)據(jù)內(nèi),顏色為J和H的數(shù)量為0捐康。
#以下為統(tǒng)計(jì)結(jié)果
Note: 95% CI for effect size estimate was computed with 100 bootstrap samples.

Note: Results from one-sample proportion tests for each level of the variable
clarity testing for equal proportions of the variable color.

# A tibble: 3 x 9
  condition N     F     H     J     `Chi-squared`    df `p-value` significance
  <ord>     <chr> <chr> <chr> <chr>         <dbl> <dbl>     <dbl> <chr>       
1 SI2       (n =~ 47.7~ 41.7~ 10.4~          16.1     2     0     ***         
2 VS1       (n =~ 42.8~ 35.7~ 21.4~           2       2     0.368 ns          
3 IF        (n =~ 100.~ NA    NA              6       2     0.05  ns          
Note: 95% CI for effect size estimate was computed with 100 bootstrap samples.

Note: Results from one-sample proportion tests for each level of the variable
clarity testing for equal proportions of the variable color.

# A tibble: 3 x 9
  condition N     F     H     J     `Chi-squared`    df `p-value` significance
  <ord>     <chr> <chr> <chr> <chr>         <dbl> <dbl>     <dbl> <chr>       
1 SI2       (n =~ 49.6~ 35.7~ 14.6~         25.6      2     0     ***         
2 VS1       (n =~ 48.1~ 31.3~ 20.4~          9.71     2     0.008 **          
3 IF        (n =~ 69.2~ 15.3~ 15.3~          7.54     2     0.023 *           
Note: 95% CI for effect size estimate was computed with 100 bootstrap samples.

Note: Results from one-sample proportion tests for each level of the variable
clarity testing for equal proportions of the variable color.

# A tibble: 3 x 9
  condition N     F     H     J     `Chi-squared`    df `p-value` significance
  <ord>     <chr> <chr> <chr> <chr>         <dbl> <dbl>     <dbl> <chr>       
1 SI2       (n =~ 44.5~ 42.0~ 13.3~         71.7      2     0     ***         
2 VS1       (n =~ 41.5~ 41.5~ 16.8~         29.6      2     0     ***         
3 IF        (n =~ 40.0~ 48.0~ 12.0~          5.36     2     0.069 ns          
Note: 95% CI for effect size estimate was computed with 100 bootstrap samples.

Note: Results from one-sample proportion tests for each level of the variable
clarity testing for equal proportions of the variable color.

# A tibble: 3 x 9
  condition N     F     H     J     `Chi-squared`    df `p-value` significance
  <ord>     <chr> <chr> <chr> <chr>         <dbl> <dbl>     <dbl> <chr>       
1 SI2       (n =~ 45.4~ 44.6~ 9.91%          84.7     2         0 ***         
2 VS1       (n =~ 49.0~ 38.5~ 12.5~          84.7     2         0 ***         
3 IF        (n =~ 52.5~ 42.3~ 5.08%          66.3     2         0 ***  
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