這本Nature旗下的6.4分SCI接收了經(jīng)典的生信數(shù)據(jù)挖掘預(yù)后模型文章捕透!

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我們都在說(shuō)現(xiàn)在基于數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘的預(yù)后模型文獻(xiàn)已經(jīng)爛大街了末购,然鵝!有人又默默的在一個(gè) 正統(tǒng)的6.4分雜志上發(fā)文章了虎谢,啥是正統(tǒng)呢招盲?就是除外咱們耳熟能祥的經(jīng)典灌水雜志。
2020年5月13日 英國(guó)諾丁漢大學(xué)醫(yī)學(xué)院諾丁漢乳腺癌研究中心等單位學(xué)者發(fā)表的數(shù)據(jù)挖掘文章發(fā)現(xiàn)了一個(gè): 基于兩個(gè)基因的預(yù)后標(biāo)簽嘉冒,影響因子 6.4分曹货。

文章簡(jiǎn)介

這項(xiàng)研究旨在使用下一代測(cè)序技術(shù)來(lái)探查TNBC切除樣品的轉(zhuǎn)錄組,以鑒定與疾病結(jié)果相關(guān)的新型生物標(biāo)志物讳推。文章應(yīng)用了兩個(gè)RNA-seq的 TNBC數(shù)據(jù)集顶籽,應(yīng)用了 supervised artificial neural network analysis進(jìn)行降維篩選預(yù)后相關(guān)的基因,接下來(lái)應(yīng)用兩個(gè)外部數(shù)據(jù)集驗(yàn)證這兩個(gè)基因:Breast Cancer Gene-Expression Miner v4. 0 and Genotype 2 outcome datasets银觅。

多變量Cox回歸分析確定了與不良預(yù)后獨(dú)立相關(guān)的預(yù)后基因特征礼饱。最后,通過(guò)使用免疫組織化學(xué)的蛋白質(zhì)表達(dá)來(lái)證實(shí)兩個(gè)基因的預(yù)后結(jié)果。人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)確定了兩個(gè)基因panel镊绪,能預(yù)測(cè)遠(yuǎn)處無(wú)轉(zhuǎn)移生存和乳腺癌特異性生存匀伏。對(duì)兩個(gè)panel共有的21個(gè)基因進(jìn)行單變量Cox回歸分析后發(fā)現(xiàn),八個(gè)基因的表達(dá)水平與不良預(yù)后獨(dú)立相關(guān)p <0.05)蝴韭。使用多因素Cox回歸分析調(diào)整臨床病理因素够颠,包括患者的年齡,等級(jí)榄鉴,淋巴結(jié)分期履磨,腫瘤大小和淋巴管浸潤(rùn),產(chǎn)生了兩個(gè)基因的預(yù)后標(biāo)簽庆尘,其與不良預(yù)后相關(guān)(p <0.05)剃诅,獨(dú)立于其他預(yù)后變量。作者又進(jìn)一步驗(yàn)證了這兩個(gè)基因的蛋白表達(dá)驶忌,并以獨(dú)立和組合方式與患者預(yù)后顯著相關(guān)(p <0.05)矛辕。

小結(jié)一下

與常見的文章分析方案,僅僅是多了一步蛋白水平的驗(yàn)證付魔,可是人家發(fā)了6.4分哦聊品?

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