使用pathview時(shí)遇到一個(gè)error投蝉，初始代碼如下：
pathview(gene.data = df_gene_KO$KEGG_ko,
pathway.id = mapID,
species = "ko",
limit = list(gene=1, cpd=1),
out.suffix = "suffix")
部分pathway可以正常生成，如ko00970
ko00970.A9_12_up.png
但是部分pathway無法生成征堪，報(bào)錯(cuò)瘩缆，如
ko01230
ko01230.png
仔細(xì)對比發(fā)現(xiàn)，這兩幅圖的區(qū)別在于：
ko00970圖中基因Kxxxxx是矩形方框佃蚜，所以可以添加顏色庸娱；ko01230中基因Kxxxxx是線條，無法添加顏色
解決辦法：
不要將顏色添加在同一圖層爽锥，修改參數(shù)same.layer = T涌韩，代碼如下：
pathview(gene.data = df_gene_KO$KEGG_ko,
pathway.id = mapID,
species = "ko",
limit = list(gene=1, cpd=1),
out.suffix = "suffix",
same.layer = T)
生成圖形：
ko01230.suffix.png
