kegg pathway解析并對應map號和ko號

昨天kegg pathway解析不是說后面補上map號和ko號的對應關系嗎诀紊,今天補上事期。

昨天的代碼一個class,里面包含幾個函數(shù)萨脑,要對應map號和ko號,只需要添加一個函數(shù)采幌,判斷map號是否有對應的ko號贴届,有就返回ko號靠粪,沒有就返回空。

添加的函數(shù)如下:

    def map2ko(self, mapid):

        ko = ""
        url = 'https://www.genome.jp/entry/pathway+'+ mapid
        response = requests.get(url, headers = self.headers)
        html = response.text

        soup = BeautifulSoup(html, "lxml")
        table = soup.find(class_="fr3").find_all("a")

        for i in table:
            i = i.get_text()

            if 'ko' in i:

                ko = i
        return ko

這就是函數(shù)化的好處毫蚓,添加功能就添加一個函數(shù)占键。為何要給ko先賦值一個“”呢?這里就不說了元潘。想必使用就無需在這里貼出來了畔乙。強烈建議添加提示信息,因為要爬取多個map號判斷是否對應ko號翩概,這個時間可能會比較長牲距,有提示信息總是要好一點。

結果如下:

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