以sratoolkit為例
對(duì)應(yīng)系統(tǒng)下載 https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/02.-Installing-SRA-Toolkit
http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-centos_linux64.tar.gz
tar -vxzf sratoolkit.tar.gz
解壓后可直接使用
11:21:12 /sratoolkit.2.10.8-centos_linux64
$ ll
總用量 64
drwxr-xr-x 3 NGB_OP 12288 6月 26 00:17 bin
-rw-r--r-- 1 NGB_OP 23052 6月 26 00:18 CHANGES
drwxr-xr-x 3 NGB_OP 4096 10月 12 2016 example
-rw-r--r-- 1 NGB_OP 5641 2月 3 2015 README-blastn
-rw-r--r-- 1 NGB_OP 2844 5月 16 2020 README.md
-rw-r--r-- 1 NGB_OP 4975 12月 5 2017 README-vdb-config
drwxr-xr-x 8 NGB_OP 4096 6月 26 00:04 schema
反之則需要makefile
11:16:08 /sra-tools-2.10.8
$ ll
總用量 92
drwxr-xr-x 5 NGB_OP 4096 6月 30 00:30 build
-rw-r--r-- 1 NGB_OP 27782 6月 30 00:30 CHANGES.md
-rwxr-xr-x 1 NGB_OP 1730 6月 30 00:30 configure
-rw-r--r-- 1 NGB_OP 2848 6月 30 00:30 LICENSE
-rw-r--r-- 1 NGB_OP 5330 6月 30 00:30 Makefile
-rw-r--r-- 1 NGB_OP 5641 6月 30 00:30 README-blastn
-rw-r--r-- 1 NGB_OP 2844 6月 30 00:30 README.md
-rw-r--r-- 1 NGB_OP 4975 6月 30 00:30 README-vdb-config
drwxr-xr-x 2 NGB_OP 4096 6月 30 00:30 scripts
drwxr-xr-x 3 NGB_OP 4096 6月 30 00:30 setup
drwxr-xr-x 2 NGB_OP 4096 6月 30 00:30 shared
drwxr-xr-x 36 NGB_OP 4096 6月 30 00:30 test
drwxr-xr-x 51 NGB_OP 4096 6月 30 00:30 tools
drwxr-xr-x 4 NGB_OP 4096 6月 30 00:30 tools2
