最近在做RNA-editing恼除,縱觀文獻綜述踪旷,相關軟件很多,但是屬reditools獨領風騷豁辉。不過還是想吐槽一下這個軟件令野,軟件是好軟件,就是文檔寫的也太不認真了吧徽级。气破。
今天先說說reditools1。
reditools1這個版本的特點是速度慢餐抢,reditools2在reditools1基礎上做出了優(yōu)化现使,速度更快了低匙。而且是快的多。朴下。
reditools的安裝有個小毛病:
首先我們要安裝依賴包:python2,fisher,pblat,samtools,tabix。
然后
git clone https://github.com/BioinfoUNIBA/REDItools
cd REDItools
python setup.py install
然而總出現(xiàn)下面這個毛病
原來是需要
mv README.md README
然后就可以了苦蒿。殴胧。。佩迟。
作者大佬怎么能犯這種錯誤呢团滥???
好了报强,下期再來吐槽reditools2吧