這篇文章發(fā)布于BioXiv欺殿。文章分析不難寄纵，解決的問題很有意思：我們通常使用細(xì)胞系來進(jìn)行體外實(shí)驗(yàn)的驗(yàn)證，但是這些細(xì)胞系是否真的能夠模擬原發(fā)腫瘤組織的生物學(xué)特點(diǎn)呢祈餐？作者的思路很清晰擂啥，利用TCGA數(shù)據(jù)庫和CCLE數(shù)據(jù)庫，評(píng)估細(xì)胞與腫瘤組織的相關(guān)性帆阳，并進(jìn)行下游的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析哺壶，最終得到了所謂的TCGA-110，就是說與各類原發(fā)腫瘤相關(guān)度最高的細(xì)胞系類型蜒谤。這些細(xì)胞系可以進(jìn)一步進(jìn)行生物學(xué)實(shí)驗(yàn)分析山宾。
作者研究的流程圖。
TCGA與CCLE數(shù)據(jù)相關(guān)性分析
分析
常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組下游
作者最后留下了一個(gè)網(wǎng)頁工具鳍徽，方便下載感興趣的數(shù)據(jù)
http://comphealth.ucsf.edu/TCGA110
參考：
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/422592v2.abstract
