文章:Long noncoding RNAs in lipid metabolism: literature review and conservation analysis across species
背景
脂質(zhì)是細胞膜的構(gòu)成荒吏,充當(dāng)信號分子和重要的能量來源抛计,脂質(zhì)穩(wěn)態(tài)過程失調(diào)是血脂異常的原因把跨,引發(fā)疾仓嫦尽:例如肥胖,糖尿病换帜,非酒精性脂肪肝疾蔡(NAFLD)或心血管疾病氓扛。
脂質(zhì)包括油三酸酯(TG),膽固醇维苔,脂肪酸和磷脂碰辅。甘油三酯中脂肪酸的儲存是主要動物的能量儲備,其在能量過剩時期構(gòu)成介时,在能量缺乏時期動員没宾。這種儲存主要發(fā)生在脂肪細胞內(nèi)的脂肪組織中凌彬。
lncRNA仔物種間保守性較低,作者在人/小鼠和雞之間發(fā)現(xiàn)5種直系同源的lncRNA循衰,可能在脂質(zhì)代謝中起重要作用铲敛。
結(jié)果
通過文獻分析,發(fā)現(xiàn)60種lncRNA參與脂質(zhì)代謝
作者列出60個潛在參與脂質(zhì)代謝的lncRNA 会钝。這些lncRNA中的大多數(shù)已在人(34)和小鼠(19)伐蒋、大鼠(1)、豬(5)和雞(4)中鑒定迁酸。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6868825/table/Tab1/?report=objectonly
lncRNA的作用機制
lncRNA的不同作用機制先鱼。a在轉(zhuǎn)錄水平上起作用的機制,b在轉(zhuǎn)錄后水平上起作用 c 對蛋白質(zhì)起作用奸鬓。d LncRNA具有小的非編碼RNA宿主的作用焙畔。E LncRNAs通過一個小翻譯ORF活動。紅色串远,lncRNA闹蒜;綠色,mRNA抑淫;藍色绷落,miRNA;綠色始苇,黃色和藍色的橢圓形球體是蛋白質(zhì)砌烁。
文獻報告了25種lncRNA的作用機制
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6868825/table/Tab2/?report=objectonly
lncRNA在物種間的保守性
作者根據(jù)基于基因組一致性的方法在雞與人(或鼠)之間進行直系同源lncRNA搜索。CRNDE催式,DHCR24-DT函喉,NFIA -AS1,PVT1和SRA1被認(rèn)為是直系同源的荣月,lncACACA管呵,DYNLRB2–2,MeXis哺窄,PLA2G1Bat1和TRIBAL可能是直系同源的lncRNA捐下。它們作用于該脂質(zhì)代謝關(guān)鍵基因的表達,如關(guān)鍵酶基因(FASN萌业,SCD坷襟,ACADS,ACADVL生年,ATGL)婴程,脂質(zhì)轉(zhuǎn)運基因(ABCA1,FABP4)或脂質(zhì)代謝轉(zhuǎn)錄因子基因(PPARA抱婉,PPARG**)档叔。因此這些lncRNA可能在脂質(zhì)代謝中起重要作用桌粉。
人/小鼠和雞基因組之間可能保守的10個lncRNA
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6868825/table/Tab3/?report=objectonly
lncRNA在人和雞的胚胎,肝臟衙四,脂肪組織和下丘腦中的表達
a人和雞之間保守的5個lncRNA 的表達铃肯。b針對此處研究的所有5種lncRNA,不同組織中所有l(wèi)ncRNA(淡色)的表達届搁。胚胎(E)缘薛,肝臟(L),脂肪組織(A)卡睦,下丘腦(H)宴胧。
方法
文獻搜索
PubMed組合術(shù)語搜索: “l(fā)ncRNA” and “associated to apolipoprotein or to the 8 lipid classes”: **sterol (cholesterol膽固醇), prenol(早搏酚), fatty acid, acylglycerol (triglyceride)甘油三酸酯, phosphoglyceride(磷酸甘油酯), glycolipids(糖脂), polyketides(聚酮化合物) and sphingolipids(鞘脂).