三十六策 第 14 策 三才合一
KEGG 把通路分為七大類砰琢，是全面覆蓋的分法:
第一類是代謝;
第二類是遺傳信息傳遞仰坦，包括基因轉錄履植、翻譯、蛋白轉運悄晃、降解等;
第三類是環(huán)境信息傳遞玫霎，包括膜轉運和信號傳導凿滤，這是疾病中最活躍的一類，跟醫(yī)學研究息息相關庶近，那些百搭通路基本都在這里面;
第四類是細胞生物學過程翁脆，包括細胞周期、凋亡鼻种、自噬反番、粘附等表型，一個表型就是一個通路;
第五類按照器官系統(tǒng)來分類的叉钥，有神經(jīng)系統(tǒng)罢缸、循環(huán)系統(tǒng)、免疫系統(tǒng)等等;
第六類是疾病投队，
第七類是藥物枫疆。
通路芯片+Western 就是基本上百分百能做出機制的萬全策略。
二元變量的 4 種模式是多元變量關系的基本構成單元蛾洛，而三元恰好回答了一個研究對象养铸，往上找驅動因素，往下找效應環(huán)節(jié)的邏輯閉環(huán)轧膘，形成了一個完整的科學故事結構钞螟。它調控了誰，以及它被誰調控都照顧到了谎碍。
基礎研究中的三元變量就是解答了一個科學現(xiàn)象也就是表型背后的三個關鍵科學問題: 主變量是誰?被上游哪個因變量調節(jié)?下游調節(jié)哪個因變量?
三元變量要先拆分成二元結構來整理鳞滨，然后再證明三元間的必要性(Rescue 驗證)。先兩兩配對把調控關系證明完蟆淀，然后 Rescue 把變量串起來拯啦。假設課題創(chuàng)新性在分子上，藥物+分子+通路中把分子作為主變 量熔任，那么藥物就是分子上游的驅動因素褒链，對藥物來說分子是新發(fā)現(xiàn)的作用靶點，而通路是分 子下游的效應環(huán)節(jié)疑苔，這是一套很規(guī)整的科學假設框架甫匹。
藥物+分子+通路
三元變量論證，根據(jù)二元邏輯拆解開有
三組關系:1)藥能調分子;2)分子能調通路;3) 藥能調通路惦费。
還有一組必要性論證兵迅，也就是 4)Rescue 環(huán)節(jié):藥調節(jié)通路依賴分子。然后跟表型相關的 Rescue 還有三條:1)藥物調節(jié)表型依賴分子;2)分子調節(jié)表型依賴于通路薪贫，3)藥物調節(jié)表型依賴于通路恍箭。
再加上兩個二元關系的直接作用細節(jié):1)藥怎么調節(jié)分子;2)分子又怎么作用于通路的具體機制
假設藥物和通路調節(jié)表型已知，那么上一策講過的二元變量論證三條原封不動: 1)分子調節(jié)表型;2)分子調節(jié)通路;3)分子調節(jié)表型依賴于通路瞧省。還需要再加上 4)藥物調節(jié)分子和通路;5)藥物調節(jié)表型依賴于分子扯夭，一共 5 條關鍵證據(jù)鏈鳍贾。
