1 Celescope背景介紹
image.png
2 CeleScope安裝
image.png
git clone 命令：git clone 拷貝一個 Git 倉庫到本地，讓自己能夠查看該項目清焕，或者進行修改。
命令格式：
git clone [url] （注：[url] 是你要拷貝的項目）
例如：git clone https://github.com/tianqixin/runoob-git-test
拷貝完成后祭犯，在當前目錄下會生成一個 runoob-git-test 目錄
運行腳本成功耐朴！
默認情況下，Git 會按照你提供的 URL 所指向的項目的名稱創(chuàng)建你的本地項目目錄盹憎。 通常就是該 URL 最后一個 / 之后的項目名稱。如果你想要一個不一樣的名字铐刘， 你可以在該命令后加上你想要的名稱
例如：git clone https://github.com/tianqixin/runoob-git-test another-runoob-name
運行腳本成功陪每！
conda create -n celescopewx
創(chuàng)建新的環(huán)境
conda activate celescopewx
激活新的環(huán)境
安裝軟件前使用自己創(chuàng)建的新環(huán)境
？pip install celescope
命令pip install是什么意思镰吵？
3檩禾、CeleScope算法
一、構(gòu)建人的參考基因組（下載基因組-解壓基因組-構(gòu)建參考基因組信息）
微信圖片_20211111104830.png
測試數(shù)據(jù)位置：/home/shpc_a98ef85f8f/software/CeleScope0723/CeleScope/test_dir
將上述截圖中的rna_1.fq.gz 和rna_2.fq.gz 拷貝到
操作.png
將上述截圖中的rna_1.fq.gz 和rna_2.fq.gz 拷貝到~/SingleronTest/wuxuan/CeleScope/test_dir/celescope_test_data/rna/fastqs中
