HBase/TiDB都在用的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu):LSM Tree奕翔,不得了解一下?


LSM Tree(Log-structured merge-tree)廣泛應(yīng)用在HBase宾袜,TiDB等諸多數(shù)據(jù)庫和存儲引擎上互艾,我們先來看一下它的一些應(yīng)用:


參考資料【4】

這么牛X的名單纫普,你不想了解下LSM Tree嗎?裝X之前节视,我們先來了解一些基本概念假栓。

設(shè)計數(shù)據(jù)存儲系統(tǒng)可能需要考慮的一些問題有:ACID匾荆,RUM(Read,Write,Memory)拌蜘。

ACID

ACID 相信小伙伴都被面試官問過简卧,我想簡單討論的一點是:如何 持久化數(shù)據(jù) 才能保證數(shù)據(jù)寫入的 事務(wù)性 和 讀寫性能烤芦?

事務(wù)性可簡單理解為:1.數(shù)據(jù)必須持久化。2.一次數(shù)據(jù)的寫入返回給用戶 寫入成功就一定成功铜涉,失敗就一定失敗遂唧。
讀寫性能可簡單理解為:一次讀 或 一次寫 需要的IO次數(shù)盖彭,因為訪問速率:CPU>>內(nèi)存>>SSD/磁盤事甜。

對于單機存儲滔韵,最簡單的方式當(dāng)然是:寫一條就持久化一條陪蜻,讀一條就遍歷一遍所有數(shù)據(jù)贱鼻,然后返回。當(dāng)然沒人這么干症昏,在內(nèi)存中我們都還知道用個HashMap呢父丰。

拿Mysql InnoDB舉例子:讀性能體現(xiàn)在數(shù)據(jù)的索引在磁盤上主要用B+樹來保證。寫性能體現(xiàn)在運用 WAL機制 來避免每次寫都去更新B+樹上的全量索引和數(shù)據(jù)內(nèi)容攘烛,而是通過redo log記錄下來每次寫的增量內(nèi)容坟漱,順序?qū)edo log寫入磁盤更哄。同時在內(nèi)存中記錄下來本次寫入應(yīng)該在B+樹上更新的臟頁數(shù)據(jù),然后在一定條件下觸發(fā)臟頁的刷盤觅捆。

redo log是數(shù)據(jù)增刪改的實時增量數(shù)據(jù)惠拭,順序?qū)懭氡WC了寫性能和事務(wù)性。磁盤上的B+樹是數(shù)據(jù)增刪改的全量數(shù)據(jù)庸论,通過定時臟頁刷盤保證這份數(shù)據(jù)的完整性职辅。

這里的問題是:雖然通過WAL機制,提高了寫入性能聂示,但是仍然避免不了臟頁數(shù)據(jù)定時刷盤的隨機IO寫入域携。因為數(shù)據(jù)在磁盤上是以block為單位存儲的(比如4K,16K),假如你更新了Order表一條數(shù)據(jù)鱼喉,又更新了Product表一條數(shù)據(jù)秀鞭,臟頁刷盤時趋观,這兩條數(shù)據(jù)在磁盤上的block位置可能差了十萬八千里锋边,就變成了隨機IO的寫入皱坛。

參考資料【3】

RUM

RUM(Read,Write,Memory)類似分布式領(lǐng)域的CAP定理。如果想得到三者中的兩者性能豆巨,必須以犧牲第三者的性能為代價剩辟。衡量這三者的性能指標(biāo)有:讀放大、寫放大往扔、空間放大贩猎。

讀放大:是指每次查詢讀取磁盤的次數(shù)。如果每次查詢需要查詢5個page (或block)萍膛,則讀放大是5.

寫放大:是指數(shù)據(jù)寫入存儲設(shè)備的量和數(shù)據(jù)寫入數(shù)據(jù)庫的量之比吭服。如果用戶寫入數(shù)據(jù)庫的大小是10MB,而實際寫入磁盤的大小是30MB蝗罗,則寫放大是3.另外SSD的寫入次數(shù)是有限的艇棕,寫放大會減少SSD的壽命。

空間放大:是指數(shù)據(jù)在存儲設(shè)備的總量和數(shù)據(jù)在數(shù)據(jù)庫的總量之比绿饵。如果用戶往數(shù)據(jù)庫上存10MB欠肾,而數(shù)據(jù)庫實際在磁盤上用了100MB去存,則空間放大就是10.

通常拟赊,數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)可以最多優(yōu)化這其中的兩者刺桃,如B+樹有更少的讀放大,LSM Tree有更少的寫放大吸祟。

下面我們將介紹LSM Tree的結(jié)構(gòu)瑟慈,它是如何解決 B+樹中“全量數(shù)據(jù)的隨機寫入” 問題的;在RUM問題上屋匕,又該如何優(yōu)化LSM Tree葛碧。

為什么要有LSM Tree

LSM Tree(Log-structured merge-tree)起源于1996年的一篇論文:The log-structured merge-tree (LSM-tree)。當(dāng)時的背景是:為一張數(shù)據(jù)增長很快的歷史數(shù)據(jù)表設(shè)計一種存儲結(jié)構(gòu)过吻,使得它能夠解決:在內(nèi)存不足进泼,磁盤隨機IO太慢下的嚴(yán)重寫入性能問題。

如果我們先后修改兩條數(shù)據(jù)纤虽,那么在臟數(shù)據(jù)塊落盤時乳绕,不是一條條隨機寫入,而是以一個臟塊批量落盤時逼纸,就能解決 B+樹中“全量數(shù)據(jù)的隨機寫入” 問題了洋措。


參考資料【3】

所以大佬設(shè)計了這么一種結(jié)構(gòu):


An LSM-tree of K+1 components

Ck tree是一個有序的樹狀結(jié)構(gòu),數(shù)據(jù)的寫入流轉(zhuǎn)從C0 tree 內(nèi)存開始杰刽,不斷被合并到磁盤上的更大容量的Ck tree上菠发。這種方式寫入是順序?qū)懙耐趼耍鰟h改操作都是append。
這樣一次I/O可以進(jìn)行多條數(shù)據(jù)的寫入滓鸠,從而充分利用每一次寫I/O雁乡。

merge所做的事情有:當(dāng)上一棵樹容量不足時,1.將上棵樹中要刪除的數(shù)據(jù)刪除掉糜俗,進(jìn)行GC回收蔗怠。2.合并數(shù)據(jù)的最新版本,使得Ck tree不會過度膨脹吩跋。

這種初始結(jié)構(gòu)存在的問題有:隨著數(shù)據(jù)量的增大,merge費勁渔工,沒有好的索引結(jié)構(gòu)锌钮,讀放大嚴(yán)重。現(xiàn)代的LSM Tree結(jié)構(gòu)如下:


參考資料【4】

MemTable:是LSM Tree在內(nèi)存中還未刷盤的寫入數(shù)據(jù)引矩,這里面的數(shù)據(jù)可以修改梁丘。是一個有序的樹狀結(jié)構(gòu),如RocksDB中的跳表旺韭。

SSTable(Sorted String Table):是一個鍵是有序的氛谜,存儲字符串形式鍵值對的磁盤文件。當(dāng)SSTable太大時区端,可以將其劃分為多個block值漫;我們需要通過 下圖中的Index 記錄下來每個block的起始位置,那么就可以構(gòu)建每個SSTable的稀疏索引织盼。這樣在讀SSTable前杨何,通過Index結(jié)構(gòu)就知道要讀取的數(shù)據(jù)塊磁盤位置了。

LSM Tree讀數(shù)據(jù)

讀數(shù)據(jù) 包括點讀和范圍讀沥邻,我們分開討論危虱。假設(shè)LSM Tree中的key為[0-99],

點讀:是指準(zhǔn)確地取出一條數(shù)據(jù)唐全,如get(23),則其示意圖為:

參考資料【4】

按照圖中標(biāo)示的順序埃跷,會先讀取內(nèi)存,在從Level0依次往高層讀取邮利,直到找到key=23的數(shù)據(jù)弥雹。

范圍讀:是指讀取一個范圍內(nèi)的數(shù)據(jù),如讀取[23-40]內(nèi)的所有數(shù)據(jù)( select * from t where key >= 23 && key <=40),

則需要做的是在每一層SSTable找到這個范圍內(nèi)的第一個block,然后遍歷block塊的數(shù)據(jù)近弟,直到不符合范圍條件缅糟。


參考資料【4】

ReadOnly MemTable:如RocksDB,在MemTable 和 Level0數(shù)據(jù)之間還有一個內(nèi)存的ReadOnly MemTable結(jié)構(gòu)祷愉。它是LSM Tree在內(nèi)存中還未刷盤的寫入數(shù)據(jù)窗宦,這里面的數(shù)據(jù)不可以修改赦颇。是當(dāng)MemTable到達(dá)一定量需要刷到SSTable時,由MemTable完整copy下來的赴涵。這樣可避免從MemTable直接刷到SSTable時的并發(fā)競爭問題媒怯。

LSM Tree寫數(shù)據(jù)

在LSM Tree寫入數(shù)據(jù)時,我們把ReadOnly MemTable畫上髓窜,示意圖如下:


當(dāng)有寫請求時扇苞,數(shù)據(jù)會先寫入MemTable,同時寫入 WAL Log;當(dāng)MemTable空間不足時寄纵,觸發(fā)ReadOnly MemTable copy,同時寫入WAL Log鳖敷;然后刷新到磁盤Level0的SSTable中。當(dāng)?shù)蛯覵STable空間不足時程拭,不斷通過Compaction和高層SSTable進(jìn)行Merge定踱。

LSM Tree合并策略

LSM Tree有兩種合并策略,Tiering 和 Leveling恃鞋。我們看圖說話:


Tiering的特點是:每層可能有N個重疊的sorted runs崖媚,當(dāng)上一層的sorted runs 要merge下來時,不會和當(dāng)前層重疊的sorted runs馬上合并恤浪,而是等到當(dāng)前層空間不足時畅哑,才會合并,然后再merge到下一層水由。

Tiering這種策略可以減小寫放大荠呐,但是以讀放大和空間放大為代價。

Leveling的特點是:每層只有一個sorted run绷杜,當(dāng)上一層的sorted run 要merge下來時直秆,會馬上和當(dāng)前層的sorted run合并。

Leveling這種策略可以減小讀放大和空間放大鞭盟,但以寫放大為代價圾结。

LSM Tree的優(yōu)化

參考資料[2-4]中的大佬們提到了不少優(yōu)化方式,我這里從讀齿诉,合并方面簡要總結(jié)下LSM Tree的優(yōu)化筝野。

點讀的優(yōu)化

盡管我們可以通過SSTable的內(nèi)存block稀疏索引結(jié)構(gòu)簡單判斷key是否可能存在于block中,但如上get(23)粤剧,如果level1讀不到歇竟,仍需要往下讀level2,level3。(因為數(shù)據(jù)是按照增刪改的時間順序一層層往下落盤的抵恋,如果一個key不存在低level中焕议,可能存在于更早的高level中)。這樣的點讀IO次數(shù)較多弧关,讀放大嚴(yán)重盅安。

布隆過濾器
對于精確查詢唤锉,hash的時間復(fù)雜度為 O(1),那么可以通過布隆過濾器來優(yōu)化别瞭。我們只需要查詢時先過一遍布隆過濾器窿祥,就能排除掉一定不存在的key了,避免不必要的IO查詢蝙寨。

布隆過濾器:是通過hash算法來判斷一個key是否存在于某個集合中晒衩,布隆過濾器通常是一個bit數(shù)組,用針對一個key多次hash算法確定的多個bit值來表示key是否存在墙歪。多個bit值全為1听系,則表示key可能存在,否則不存在虹菲。好處是多個bit值通常比直接存儲一個存在的key占用空間小跛锌,省內(nèi)存。

分層布隆過濾器
上述布隆過濾器是假設(shè)每層數(shù)據(jù)都使用相同的布隆過濾器來進(jìn)行過濾届惋,而數(shù)據(jù)隨著層數(shù)的增加通常是指數(shù)級增長的,如果使低層的數(shù)據(jù)使用更精確的布隆過濾器(所需bit數(shù)更多菠赚,但是精確度更高),高層的數(shù)據(jù)使用稍微不那么精確的布隆過濾器脑豹,則整體點查的效率將提高。參考資料【3】中Monkey做了上述優(yōu)化衡查,即使隨著數(shù)據(jù)量和層數(shù)的增大瘩欺,點查仍能保持在一個穩(wěn)定的時間內(nèi)。

范圍讀的優(yōu)化

Hash的不足就是無法支持范圍查詢索引拌牲,優(yōu)化方式有:
并行查詢
因為讀數(shù)據(jù)不存在競爭問題俱饿,可以并行讀每層的數(shù)據(jù),縮短整體查詢時間塌忽,但是這種方式實際并沒有縮短IO次數(shù)拍埠。

前綴布隆過濾器
前綴布隆過濾器是以key的前綴來Hash構(gòu)建布隆過濾器,而不是key本身的值土居。這樣可以起到過濾 like Monica* 這樣的查詢條件作用枣购。RocksDB有做此優(yōu)化。

合并的優(yōu)化

上面提到了兩種合并策略Tiering 和 Leveling擦耀。Tiering可以減小寫放大棉圈,Leveling可以減小讀放大和空間放大。參考資料【3】中提到了數(shù)據(jù)庫所采用的合并策略走勢如下:


隨著數(shù)據(jù)量的增大眷蜓,整條曲線會上移分瘾。優(yōu)化的重點在于:如何結(jié)合兩種合并策略,使曲線整體下移吁系。
Lazy Leveling
參考資料【3】中Dostoevsky采用了一種Lazy Leveling的策略:它是對低層數(shù)據(jù)采用Tiering合并策略德召,對高層數(shù)據(jù)采用Leveling合并策略白魂。從而權(quán)衡了讀寫性能。

RUM的取舍

RUM的取舍和權(quán)衡類似于分布式領(lǐng)域的CAP氏捞,在特定的場景采用適合的優(yōu)化手段才能使整體性能最優(yōu)碧聪。參考資料【3】中的大佬還提到了Fluid Merge策略。233醬表示雖過了眼癮液茎,但仍是個CRUD渣渣逞姿。

關(guān)于RUM的優(yōu)化,233醬最后放一張圖捆等,希望對你我有所啟發(fā)滞造。



后記

LSM Tree是這兩年一直聽到的名詞,但是一直沒有花時間搞懂它栋烤。233醬趁這次機會現(xiàn)學(xué)現(xiàn)賣谒养,對其有了更深一步的了解。

對本文內(nèi)容感興趣的小伙伴可進(jìn)一步閱讀參考資料明郭,如果文中有錯誤或者不理解的地方也歡迎小伙伴們和我交流指正买窟。

另外,如果覺得有收獲也請幫忙 四連【關(guān)注薯定,點贊始绍,再看,轉(zhuǎn)發(fā)】 支持一下233醬话侄,謝謝~

參考資料:
[1].https://kernelmaker.github.io/lsm-tree
[2].https://www.youtube.com/watch?v=aKAJMd0iKtI
[3].https://www.youtube.com/watch?v=b6SI8VbcT4w
[4].https://www.bilibili.com/video/BV1fb411x7zz?from=search&seid=8679886514280300283
[5].https://tikv.github.io/deep-dive-tikv/key-value-engine/B-Tree-vs-Log-Structured-Merge-Tree.html

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
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