學(xué)習(xí)Day4——宣Xuanan

安裝過程中--中文路徑--的問題還是值得記錄一下储笑!跳坑指南:用搜狗微信搜索---“生信星球 當(dāng)Rstudio杠上中文用戶名”.

認(rèn)識(shí)R和Rstudio

R是一門用于統(tǒng)計(jì)計(jì)算和作圖的語言,受S語言影響發(fā)展而來。它匯集了許多函數(shù)透典,能夠提供強(qiáng)大的功能刽宪。R語言軟件界面簡陋,追求視覺體驗(yàn)诚卸,用戶通常選擇使用圖形界面的Rstudio來替代R軟件葵第。

RStudio是免費(fèi)提供的開源集成開發(fā)環(huán)境(IDE)。RStudio提供了一個(gè)具有很多功能的環(huán)境合溺,使R更容易使用卒密,是在終端中使用R的絕佳選擇。

Rstudio界面

如下圖所示棠赛,界面可以分為四個(gè)部分:

image

設(shè)置Rstudio字體大小

image

R語言基本操作

Rproject管理工作目錄

當(dāng)你有多個(gè)項(xiàng)目并行的話哮奇,應(yīng)該避免全都在一個(gè)文件夾下,所以選擇設(shè)置對(duì)應(yīng)多個(gè)項(xiàng)目的多個(gè)工作目錄睛约。干貨指南----用搜狗微信搜索:“生信星球 R-project管理多個(gè)R工作目錄”.

顯示文件列表
dir()鼎俘;list.files():顯示默認(rèn)路徑,也就是工作目錄(直接打命令不跟路徑)辩涝,相當(dāng)于linux的ls贸伐。
加減乘除
image
賦值

賦值符號(hào)用小于號(hào)加上減號(hào)打出 <-,或者快捷鍵Alt加減號(hào)怔揩。例如捉邢,x<- 1+2 即把1+2的運(yùn)算結(jié)果賦值給x, 按enter鍵賦值后沧踏,x會(huì)在右上角Globe Environment的Value列表顯示歌逢。在控制臺(tái)再輸入x, 回車翘狱,即返回x的值秘案。

刪除變量

rm(b) #刪除變量b
rm(u,c) #刪除變量u和變量c
rm(list = ls()) #清空所有變量

列出歷史命令

history() ----相當(dāng)于鼠標(biāo)單擊右上角的history標(biāo)簽,運(yùn)行之后,我們可以在右上角的History界面中看到剛剛使用過的命令阱高∽迹或者我們可以直接右鍵點(diǎn)擊History來查看歷史命令。
另外赤惊,在History命令中雙擊某個(gè)命令吼旧,這個(gè)命令便會(huì)出現(xiàn)在左下角的控制臺(tái),方便我們再次使用同樣的命令未舟。

清空控制臺(tái)

ctrl+l 快捷鍵

作者:夏目14
鏈接:http://www.reibang.com/p/5092416bc79e
來源:簡書
著作權(quán)歸作者所有圈暗。商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)聯(lián)系作者獲得授權(quán),非商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處裕膀。

下面的內(nèi)容是R for data science里ggplot繪圖基礎(chǔ)內(nèi)容
涉及到的R包有:ggplot2
數(shù)據(jù):R內(nèi)置的mpg

mpg
# A tibble: 234 x 11
   manufacturer model      displ  year   cyl trans      drv     cty   hwy fl    class  
   <chr>        <chr>      <dbl> <int> <int> <chr>      <chr> <int> <int> <chr> <chr>  
 1 audi         a4           1.8  1999     4 auto(l5)   f        18    29 p     compact
 2 audi         a4           1.8  1999     4 manual(m5) f        21    29 p     compact
 3 audi         a4           2    2008     4 manual(m6) f        20    31 p     compact
 4 audi         a4           2    2008     4 auto(av)   f        21    30 p     compact
 5 audi         a4           2.8  1999     6 auto(l5)   f        16    26 p     compact
 6 audi         a4           2.8  1999     6 manual(m5) f        18    26 p     compact
 7 audi         a4           3.1  2008     6 auto(av)   f        18    27 p     compact
 8 audi         a4 quattro   1.8  1999     4 manual(m5) 4        18    26 p     compact
 9 audi         a4 quattro   1.8  1999     4 auto(l5)   4        16    25 p     compact
10 audi         a4 quattro   2    2008     4 manual(m6) 4        20    28 p     compact
# ... with 224 more rows

ggplot繪圖基本結(jié)構(gòu)

ggplot(data = <DATA>) +
<GEOM_FUNCTION>(mapping = aes(<MAPPINGS>))

在圖形上添加變量

重要的概念:圖形屬性映射员串,就是將你要在圖片上體現(xiàn)的變量,用不同的圖形屬性表現(xiàn)出來昼扛,比如寸齐,你已經(jīng)用xy軸來定義所有汽車的引擎大小和燃油效率,是用散點(diǎn)圖的形式展現(xiàn)抄谐,圖片上所有的點(diǎn)代表所有的汽車渺鹦,但是你想讓汽車種類在圖上也有所體現(xiàn),這時(shí)候就想用圖片的顏色來區(qū)分不同的汽車種類蛹含,或者用形狀毅厚、大小來區(qū)分也可以。簡而言之:將變量信息通過圖形的可視化屬性展現(xiàn)出來挣惰。

ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy, color = class))

aes是將變量信息和圖形屬性相連接卧斟,如果要改變整個(gè)圖形的外觀,需要放在aes括號(hào)外憎茂。

ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy), color = "blue")

另一種添加變量的方式是分面

ggplot(data = mpg) +
  geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
  facet_wrap(~ year, nrow = 2)  
ggplot(data = mpg) +
  geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
  facet_grid(drv ~ cyl)   ##drv放在y軸珍语,cyl放在x軸,下圖
ggplot(data = mpg) +
  geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
  facet_grid(. ~cyl)  ###cyl在x軸
ggplot(data = mpg) +
  geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy)) +
  facet_grid(drv~ .) ##drv在軸

image

幾何對(duì)象

指我們表示數(shù)據(jù)的幾何對(duì)象類型竖幔,如條形圖使用條形幾何圖像

ggplot(data=mpg)+
  geom_smooth(mapping = aes(x=displ,y=hwy,linetype=drv)

image

如果想要得到這個(gè)圖形:

image

剛開始自己寫的

ggplot(data=mpg)+
  geom_smooth(mapping = aes(x=displ,y=hwy,linetype=drv,color=drv))+
  geom_point(mapping = aes(x=displ,y=hwy,color=drv))

或者

ggplot(data=mpg,mapping=aes(x=displ,y=hwy,color=drv))+
  geom_point()+
  geom_smooth(mapping = aes(linetype=drv))

作者:周ZHX
鏈接:http://www.reibang.com/p/b81e34559c43
來源:簡書
著作權(quán)歸作者所有板乙。商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)聯(lián)系作者獲得授權(quán),非商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處拳氢。

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
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