請(qǐng)移步修改版本:matlab,python讀取nii格式的醫(yī)學(xué)影像CT數(shù)據(jù) - 簡書
最近想用LiTS- Liver Tumor Segmentation Challenge的數(shù)據(jù)集做些事情地来,下載數(shù)據(jù)后發(fā)現(xiàn)是nii格式的饵骨,使用imageJ可以直接讀取并且顯示還可以進(jìn)行3D渲染瞧毙,但是要做處理的話還是需要用matlab或者python進(jìn)行讀取贮缅。
matlab讀取方法:
使用Tools for NIfTI and ANALYZE image工具包铐维,下載地址如下:
https://cn.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/8797-tools-for-nifti-and-analyze-image?s_tid=srchtitle
將工具包解壓到MATLAB的路徑下懈词,解壓后的文件名字為NIfTI_20140122,其實(shí)可以是任意路徑结闸,然后如如下語句即可讀取
addpath('D:\MATLAB\NIfTI_20140122')
info? = load_nii ('test-volume-68.nii');
image = info.img;
python讀取方法:
使用PyNIfTI包唇兑,官網(wǎng)地址如下:http://niftilib.sourceforge.net/pynifti/examples.html#loading-and-saving-nifti-files
使用命令即可安裝:
apt-get install python-nifti
使用代碼:
from nifti import*
nim=NiftiImage('example4d.nii')
print nim.filename