matlab 讀取nii格式的醫(yī)學(xué)影像CT數(shù)據(jù)

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最近想用LiTS- Liver Tumor Segmentation Challenge的數(shù)據(jù)集做些事情地来,下載數(shù)據(jù)后發(fā)現(xiàn)是nii格式的饵骨,使用imageJ可以直接讀取并且顯示還可以進(jìn)行3D渲染瞧毙,但是要做處理的話還是需要用matlab或者python進(jìn)行讀取贮缅。

matlab讀取方法:

使用Tools for NIfTI and ANALYZE image工具包铐维,下載地址如下:

https://cn.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/8797-tools-for-nifti-and-analyze-image?s_tid=srchtitle

將工具包解壓到MATLAB的路徑下懈词,解壓后的文件名字為NIfTI_20140122,其實(shí)可以是任意路徑结闸,然后如如下語句即可讀取

addpath('D:\MATLAB\NIfTI_20140122')

info? = load_nii ('test-volume-68.nii');

image = info.img;

python讀取方法:

使用PyNIfTI包唇兑,官網(wǎng)地址如下:http://niftilib.sourceforge.net/pynifti/examples.html#loading-and-saving-nifti-files

使用命令即可安裝:

apt-get install python-nifti

使用代碼:

from nifti import*

nim=NiftiImage('example4d.nii')

print nim.filename

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