從抽象的CRF到具體的SDTM數(shù)據(jù)集

昨天忘記說了哩照,能考公務(wù)員就考公務(wù)員丽旅!尤其是江浙滬或者是大灣區(qū)的椰棘。

對很多初學(xué)者來說,從CRF上的數(shù)據(jù)到SDTM標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集榄笙,這一過程是怎樣的不是很清楚邪狞,今天我就來講講。

拿下面的一個空白CRF來說茅撞,收集的是心電圖的數(shù)據(jù)帆卓,我們知道這些數(shù)據(jù)肯定要放到EG domain里。

這個空白CRF上面(我標(biāo)的數(shù)字有7個)米丘,分別對應(yīng)到raw數(shù)據(jù)集里面有7個變量剑令。(subjid幾乎每個數(shù)據(jù)集都是默認(rèn)存在的)

上面顯示的就是我們從DM那邊得到的數(shù)據(jù),一行觀測可以理解為CRA在CRF上記錄了一頁數(shù)據(jù)拄查,每一個變量分別代表圖中的7個數(shù)字吁津,比如1代表“EGPERF”,也就是“是否做心電圖檢查:”=EGPERF堕扶。6代表EGRESULT,也就是結(jié) 果:=“EGRESULT”碍脏。變量的值就代表CRA勾選了哪些值。

所以圖中有16條觀測稍算,那么可以理解為CRA用了16張關(guān)于EG的CRF來記錄受試者數(shù)據(jù)典尾,然后輸入到EDC系統(tǒng)中,不知道大家能不能抽象過來糊探。

假設(shè)上面的數(shù)據(jù)集是經(jīng)過DM清理之后發(fā)給我們的原始數(shù)據(jù)钾埂,這時候的數(shù)據(jù)并不符合CDISC標(biāo)準(zhǔn),所以我們需要經(jīng)過處理將他們轉(zhuǎn)換成標(biāo)準(zhǔn)的SDTM數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)科平。

首先就是注釋CRF褥紫,將空白CRF上注釋成擁有SDTM變量的CRF,然后寫SPEC的SAS程序員將轉(zhuǎn)換的過程方法寫在EXCEL上匠抗,其他SAS程序員根據(jù)這個說明故源,結(jié)合aCRF將raw數(shù)據(jù)集轉(zhuǎn)換成標(biāo)準(zhǔn)的EG數(shù)據(jù)集。

而且汞贸,注意到raw數(shù)據(jù)集是水平結(jié)構(gòu),但是SDTM一般是垂直結(jié)構(gòu)印机,也就是說矢腻,你看raw數(shù)據(jù)集,HR和QTC都在一條水平線上射赛,但是按照SDTM的要求多柑,必須一個檢查項一條記錄,下面這個截圖就是相對標(biāo)準(zhǔn)的EG數(shù)據(jù)集楣责,符合SDTM標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)集竣灌。(只拿S001來舉例子聂沙,當(dāng)然少了很多其他關(guān)于EG的變量)

你們自己去看看理解吧。阿尼瑪初嘹,真的太費時間了給你們舉這些例子及汉,又是截圖又是注釋的。

總之屯烦,我們SAS程序員的工作流程就是下面這張圖所示:

然后過程之間肯定有很多小步驟坷随。

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