代謝組學簡介

“基因組學或轉(zhuǎn)錄組學告訴你可能發(fā)生什么,蛋白質(zhì)組學告訴你正在發(fā)生什么,而代謝組學則告訴你已經(jīng)發(fā)生了什么猴娩!”-----Bill Lasley, UC Davis

《Metabolomics as a tool toidentify biomarkers to predict and improve outcomes in reproductive medicine: asystematic review》

代謝概念:包含生物合成和生物分解兩大過程瘫俊。

代謝物:通過代謝過程產(chǎn)生或消耗的物質(zhì)毫蚓,生物大分子不包括在內(nèi)沪悲,生物大分子的前體及降解產(chǎn)物是代謝物穷当。

代謝組學的特點:1.相對于其他組學研究提茁,檢測技術相對簡單(液-質(zhì)聯(lián)用,氣-質(zhì)聯(lián)用及核磁)2.代謝組學是體內(nèi)外多種綜合因素的最終結(jié)果馁菜。

代謝組學的應用:生物標志物尋找茴扁,治療療效的監(jiān)控,疾病分型汪疮,中藥研究中的治病機理峭火,毒副作用評價。

代謝組學常用數(shù)據(jù)庫:HMDB (http://www.hmdb.ca), KEGG, SMPDB (http://www.smpdb.ca/)等铲咨。

代謝組學研究思路:

1.?通過差異分析得到差異代謝物后躲胳,對大樣本數(shù)據(jù)進行KM,ROC纤勒,Cox等分析坯苹,發(fā)現(xiàn)臨床生存及疾病預測價值。

2.?差異代謝物進行功能研究摇天,抗代謝物或者是添加外源代謝物粹湃,細胞及動物實驗驗證該代謝物對表型的重要性恐仑。

3.?多組學研究,根據(jù)代謝物找到上游調(diào)控蛋白为鳄,對上游蛋白進行研究裳仆。

文章推薦:《Functional Metabolomics Characterizes a Key Role for N-Acetylneuraminic?Acid in Coronary Artery Diseases》IF=23

該文章確定代謝物N-Acetylneuraminic Acid在冠狀動脈疾病進展中的作用機制。

《PML-Regulated Mitochondrial Metabolism Enhances Chemosensitivity in Human Ovarian Cancers》IF=22.4

本文章運用多組學聯(lián)合分析的方法孤钦。

總結(jié):從代謝物角度研究疾病發(fā)展歧斟,目前仍然是較新的研究思路。而且代謝物作為臨床檢測的指標也具有穩(wěn)定性高偏形,易于檢測的優(yōu)勢静袖。

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