R包學(xué)習(xí)框架
R包
R包安裝及加載
- 鏡像設(shè)置
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")分別對應(yīng)清華源和中科大源的鏡像 - 安裝
install.packages(“包”)存在于CRAN網(wǎng)站；BiocManager::install(“包”)存在于bioconductor
- 加載
libarary(包)和require(包)均可
dplyr五個基礎(chǔ)函數(shù)
- 新增列
使用test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]調(diào)用內(nèi)置數(shù)據(jù)集（iris為常用的分類實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)集，調(diào)用向量數(shù)據(jù)后對test變量進(jìn)行賦值）萄涯；
使用mutate()進(jìn)行新增列(定義new=前兩列數(shù)據(jù)的乘積)
- 按列篩選
- 按照列號篩選扣典，使用命令
select(test,5)進(jìn)行第5列數(shù)據(jù)提取趾诗；
使用命令select(test,c(2,3))進(jìn)行第2和第3列數(shù)據(jù)提取
- 按照列名進(jìn)行篩選，使用命令
select(test,Sepal.Width)篩選出以Sepal.Width命名的那一列
使用命令select(test,Sepal.Length,Petal.Length)可篩選兩列數(shù)據(jù)
使用vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width") select(test, one_of(vars))對vars進(jìn)行賦值
- 篩選行，使用
filter()篩選行 - 對整個表格排序恃泪，使用
arrange()
- 進(jìn)行匯總郑兴，使用命令
summaries()
使用group_by()
dplyr兩個使用技能
- 管道操作，
%>%是最常用的一個操作符贝乎，就是把左側(cè)準(zhǔn)備的數(shù)據(jù)或表達(dá)式情连，傳遞給右側(cè)的函數(shù)調(diào)用或表達(dá)式進(jìn)行運(yùn)行，可以連續(xù)操作就像一個鏈條一樣
- 對可擴(kuò)展單元格或集合表達(dá)式進(jìn)行計數(shù)览效，使用
count
dplyr處理關(guān)系數(shù)據(jù)
- 將兩個表進(jìn)行連接却舀，在建立數(shù)據(jù)框時候加入語句
stringsAsFactors = FALSE
此時數(shù)據(jù)框?qū)⒉粫J(rèn)把字符型轉(zhuǎn)化為因子，運(yùn)行代碼 - 取兩個表數(shù)據(jù)中的交集朽肥，使用
inner_join() -
左連（左表的所有數(shù)據(jù)列出禁筏，右表的相同部分列出，不同部分用null 補(bǔ)齊）
- 全連衡招，是取兩個表的并集篱昔，使用
full_join() -
半連接，為了方便說明半連接的含義始腾，這里我們用"t1.x semi= t2.y"來表示表T1和表T2做半連接州刽，且T1是驅(qū)動表，T2是被驅(qū)動表浪箭，半連接條件為t1.x=t2.y穗椅。這里"t1.x semi= t2.y"的含義是只要在表T2中找到一條記錄滿足t1.x=t2.y，則馬上停止搜索表T2奶栖，并直接返回表T1中滿足條件t1.x=t2.y的記錄匹表。也就是說，表T2中滿足半連接條件t1.x=t2.y的記錄即使有多條宣鄙，表T1中也只會返回第一條滿足條件的記錄袍镀。所以半連接和普通的內(nèi)連接不同，半連接實(shí)際上會去重（兩表關(guān)聯(lián)冻晤，只返回匹配上的數(shù)據(jù)并且只會返回一張的表的數(shù)據(jù)苇羡，半連接一般就是指的在子查詢中出現(xiàn) IN 和 EXISTS）。
- 反連接鼻弧，兩表關(guān)聯(lián)设江，只返回主表的數(shù)據(jù)，并且只返回主表與子表沒關(guān)聯(lián)上的數(shù)據(jù)攘轩，這種連接就叫反連接叉存。反連接一般就是指的 NOT IN 和 NOT EXISTS，使用命令
anti_join() - 簡單合并度帮，使用
bind_rows()鹉胖，bind_cols()
