HyPhy(Hypothesis Testing using Phylogenies)
An open-source software package
for comparative sequence analysis using stochastic evolutionary models
1. 配置好Linux環(huán)境，可以參考Linux的windows10子系統(tǒng) (WSL) 配置
2. 安裝HyPhy(分布式并行運(yùn)算環(huán)境的安裝可以參考官方文檔 installation)
sudo apt-get update
sudo apt-get install -y build-essential cmake
git clone https://github.com/veg/hyphy.git
cd hyphy
#beta 版本
#git checkout beta
cmake .
make MP
sudo make install
3. 使用方式
a.常用使用方式
輸入
HYPHYMP
就可以按照提示一步步設(shè)置參數(shù)進(jìn)行運(yùn)算
