今天的學(xué)習(xí)內(nèi)容是R語言的基本數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)：
Day5學(xué)習(xí)內(nèi)容.png
在這些數(shù)據(jù)類型里晓避，我們主要學(xué)習(xí)的是向量與數(shù)據(jù)框這兩種只壳。
1、向量
（1）區(qū)分標(biāo)量和向量
- 元素：數(shù)字或字符串（使用時要加引號）
- 標(biāo)量：一個元素組成的變量
- 向量：多個元素組成的變量锅必，有序排列
使用時惕艳，一般都會直接給變量定義，也就是“賦值”尔许，字面意思是賦予這個變量一個數(shù)值（或者是字符串/數(shù)據(jù)框等）终娃。
x<- c(1,2,3) #由元素1，2棠耕，3組成的向量
x<- 1:10 #從1-10之間所有的整數(shù)
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之間每隔0.5取一個數(shù)
x<- rep(1:3,times=2) #1-3窍荧，重復(fù)2次
賦值結(jié)果如下：
賦值.png
（2）從向量中提取元素
- 根據(jù)元素的位置
x[3] #第3個元素
x[-3] #排除法，除了第3個元素之外剩余的元素
x[1:3] #第1-3個元素
x[-(1:3)] #除了第1-3個元素
x[c(1,3)] #第1個和第3個元素
根據(jù)位置提取元素.png
- 根據(jù)值
x[x==1] #等于1的元素
x[x<2] #小于2的元素
x[x %in% c(1,2,5)] #存在于向量c(1,2,5)中的元素
根據(jù)值提取元素.png
2魂拦、數(shù)據(jù)框
- 首先要將示例數(shù)據(jù)放在工作目錄下
（1）讀取本地數(shù)據(jù)
讀取本地數(shù)據(jù).png
sep參數(shù)用來指定字符的分隔符號，常用的有
sep = ","箱靴、sep = "\t"和sep = " "荷愕。header = FALSE表示第一行即為具體數(shù)據(jù)，header = TRUE表示第一行用于列名稱抛杨，具體數(shù)據(jù)從第二行開始荐类。
（2）設(shè)置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例數(shù)據(jù)里有doudou.txt，這里的變量X是一個數(shù)據(jù)框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名玉罐，默認(rèn)行名就是行號吊输，1、2璧亚、3脂信、4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet" #修改第一列列名
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header = T,row.names = 1) #最后row.names的意思是修改第一列為行名
（3）數(shù)據(jù)框的導(dǎo)出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
分隔符改為逗號，字符串不加雙引號疯搅。
（4）變量的保存與重新加載
沒有處理完的數(shù)據(jù)下次想接著用要進行保存，格式是RData罪治。
save.image(file="bioinfoplanet.RData") #保存當(dāng)前所有變量
save(X,file="test.RData") #保存其中一個變量
load("test.RData") #再次使用RData時的加載命令
（5）提取元素
X[a,b] #第a行第b列
X[a,] #第a行
X[,b] #第b列
X[b] #也是第b列
X[a:b] #第a到b列
X[c(a,b)] #第a和第b列
X$列名 #提取某一個特定的列
（6）直接使用數(shù)據(jù)框中的變量
iris是R語言的內(nèi)置數(shù)據(jù)礁蔗，可以直接使用。提取某兩列作散點圖：
plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)
plot.png
腳本的使用和保存：
- 將代碼復(fù)制或手打到一個新的R腳本中
- 然后保存到工作目錄下
- 打開發(fā)現(xiàn)腳本文件的后綴就是R
- 要用時直接找到它晒骇，用Rstudio打開
3磺浙、作業(yè)
問題：save(X,file="test.RData")這句代碼如果報錯object X not found撕氧，是為什么，應(yīng)該怎么解決伦泥？
答：出現(xiàn)object X not found說明賦值出了問題，可能是沒有區(qū)分大小寫府怯。所以將X進行正確的賦值即可跨新。
本學(xué)習(xí)內(nèi)容參考微信公眾號：生信星球
