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概述
下文列出了若干有助于您規(guī)劃和執(zhí)行實驗的網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫和資源奠旺。這些網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫和資源包括抗體資源、蛋白質(zhì)組工具施流、疾病數(shù)據(jù)庫和突變數(shù)據(jù)庫以及幾個為信號轉(zhuǎn)導研究提供實用工具的網(wǎng)站响疚。
信號轉(zhuǎn)導研究
預測蛋白質(zhì)內(nèi)部的磷酸化位點和特定結(jié)構(gòu)域結(jié)合區(qū),MIT瞪醋。
NetPhos 2.0 Server www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos
真核蛋白中磷酸化位點神經(jīng)網(wǎng)絡預測忿晕,丹麥技術(shù)大學。
Kinase.com www.kinase.com
來自人類趟章、酵母杏糙、蠕蟲和蠅類的蛋白激酶的分析夯到。AAAS | Science's STKE stke.sciencemag.org
信號轉(zhuǎn)導知識環(huán)境:關(guān)于信號轉(zhuǎn)導的資源和信息吴攒,科學雜志和斯坦福大學。需要訂閱医增。BioCarta - Charting Pathways of Life* www.biocarta.com/search/index.asp“開源”資源蜀漆,提供在線圖谅河,描繪了已選的信號轉(zhuǎn)導通路。
細胞周期調(diào)節(jié)型酵母基因 genome-www.stanford.edu/cellcycle識別其 mRNA 水平受細胞周期調(diào)控的酵母基因确丢,斯坦福绷耍。
Horst Ibelgaufts’ COPE:細胞因子及細胞在線探索者百科全書 www.copewithcytokines.org
細胞因子及細胞百科全書,慕尼黑大學鲜侥。
GPCRDB:G 蛋白偶聯(lián)受體 (GPCR) 信息系統(tǒng) www.gpcr.org/7tm
G 蛋白偶聯(lián)受體信息系統(tǒng)褂始。
NetOGlyc 3.1服務器 www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc
哺乳動物蛋白質(zhì)中的 GalNAc O-糖基化位點預測,丹麥技術(shù)大學描函。
SenseLab senselab.med.yale.edu
合作努力崎苗,建立神經(jīng)元和神經(jīng)系統(tǒng)的一體化多學科模型,耶魯大學舀寓。
生物信息學與生物計算 bip.weizmann.ac.il
對可能在常見疾病中發(fā)揮關(guān)鍵作用的‘熱點分子’作了詳盡注釋胆数,魏茨曼研究所。
在線鏈接網(wǎng)關(guān)
圣迭戈超級計算機中心:提供信息化基礎(chǔ)設施 www.sdsc.edu
有關(guān)分子生物學和蛋白質(zhì)組學工具和資源的優(yōu)秀合集互墓,圣迭戈加利福尼亞大學必尼。
細胞和分子生物學在線 www.cellbio.com
細胞生物學和分子生物學信息資源。
TIGEM Telethon 遺傳學和醫(yī)學研究所 www.tigem.it
表達序列標簽分析的資源鏈接篡撵,布雷西亞大學判莉。
在線出版物和文獻搜索引擎
Entrez PubMed www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed
NLM 提供的 MEDLINE 引文檢索服務,含有在線期刊和其他相關(guān)數(shù)據(jù)庫的鏈接育谬,N.I.H骂租。
PubCrawler 網(wǎng)絡服務 pubcrawler.gen.tcd.ie/
免費“提醒”服務,瀏覽 NCBI斑司、Medline 和 GenBank 數(shù)據(jù)庫的每日更新渗饮。
公共科學圖書館 www.plos.org
致力于使世界科技和醫(yī)學文獻成為全世界的科學家和公眾都能夠免費獲取的公共信息資源。
疾病和突變數(shù)據(jù)庫
KinMutBase bioinf.uta.fi/KinMutBase
酪氨酸激酶結(jié)構(gòu)域中致病突變數(shù)據(jù)庫及通往其他突變數(shù)據(jù)庫的鏈接宿刮,坦佩雷大學互站。
癌癥染色體圖集 atlasgeneticsoncology.org
腫瘤學和血液學中的遺傳學和細胞遺傳學圖集,致力于癌癥和癌傾向疾病的生物方面和分子方面僵缺。</dd>
OMIM——在線人類孟德爾遺傳 www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=OMIM
在線人類孟德爾遺傳:人類基因和遺傳病分類胡桃,N.I.H。
人類基因突變數(shù)據(jù)庫 (HGMD) www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php
人類基因突變數(shù)據(jù)庫磕潮,醫(yī)學遺傳學研究所翠胰,卡迪夫大學容贝。
OMIM 基因座特異性突變數(shù)據(jù)庫鏈接www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/allresources.html#LocusSpecific
通往多個基因座特異性突變數(shù)據(jù)庫的鏈接,N.I.H之景。
致病基因 www.ncbi.nlm.nih.gov/disease/
按位置克隆的人類致病基因斤富,N.I.H。
CGAP 合作 www.ncbi.nlm.nih.gov/ncicgap
癌癥基因組剖析計劃:致癌基因數(shù)據(jù)庫锻狗,N.I.H满力。
基因剔除和轉(zhuǎn)基因小鼠
JAX 小鼠數(shù)據(jù)庫 jaxmice.jax.org/query/
轉(zhuǎn)基因或具有靶向或化學誘導型突變的小鼠品系的來源,杰克遜實驗室轻纪。
基因組數(shù)據(jù)庫
TIGR 人類基因索引 compbio.dfci.harvard.edu/tgi/
TIG 人類基因索引油额。
Mitomap www.mitomap.org
人類線粒體基因組,埃默里大學刻帚。
MGI 3.3——小鼠基因組信息學 www.informatics.jax.org
小鼠基因組潦嘶,杰克遜實驗室。
伯克利果蠅基因組計劃 www.fruitfly.org
果蠅基因組計劃崇众,伯克利衬以。
桑格研究所:秀麗隱桿線蟲計劃 www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans
秀麗隱桿線蟲基因組,桑格中心校摩。酵母屬基因組數(shù)據(jù)庫* www.yeastgenome.org
釀酒酵母基因組看峻,斯坦福。
原文:實用網(wǎng)絡資源