隨筆 | 「生物軟件開發(fā)」一把死鎖

「生物信息」概念被提出已有許多年帘饶,可以說比我年齡大了許多哑诊。但到底是什么,不同人有不同定義及刻。尤其自高通量測序出現(xiàn)镀裤,對于生物信息來說,有一大波變化缴饭。而我時常與相似背景的朋友提及暑劝,我們其實都是吃了這一波紅利。不然也保不齊現(xiàn)在如何颗搂,當然以我們的努力程度担猛,做其他估計也不會很差。
總的來說,我個人覺得搞「生物軟件」或者「生信軟件」開發(fā)或許也可以算生物信息的范疇傅联。但至于科班的定義先改,就不太清楚了。從做生物學問題挖掘的角度來說蒸走,我們肯定是需要一些好用的「生物軟件」仇奶。諸如現(xiàn)在各式各樣的變異檢測,比較基因組云云比驻,如何更好地探索數(shù)據(jù)该溯,是一個問題。
我們需要好用的工具别惦,但是沒有人開發(fā)出來過朗伶;我們有許多想要的功能,許多想法步咪,但是我們不可能抽出時間開發(fā)论皆,因為我們是做生物學問題挖掘的,做生物信息學在生物學研究上的應用的猾漫,分析好當前的數(shù)據(jù)就足夠了点晴,開發(fā)一款軟件往往顯得本末倒置。絕大多數(shù)人與我們一樣悯周,所以這是一個死鎖粒督。
絕大多數(shù)人都需要,但是絕大多數(shù)人都不會去做禽翼,也不愿意去做屠橄,甚至不可能去做。因為闰挡,這也是一個事實锐墙,我們還有更重要的事情去做。
從單一項目的角度來說长酗,沒有錯溪北,因為項目只有3~5年;從個人事業(yè)的角度來說夺脾,也沒有錯之拨,因為很可能軟件開發(fā)出來,人生的一個階段也就結束了咧叭;但是從整體科研工作人員需要來說蚀乔,又是否值得?
我們有很多更重要的事情要做菲茬,哪個更重要吉挣,如何去平衡派撕,如何去權衡。這是一個問題听想。
有些人可能會問腥刹,為什么就不可能找人合作马胧,你們完全可以交叉學科汉买。但這么問的朋友往往沒有交叉過。很多時候佩脊,不同領域的人蛙粘,理念難以統(tǒng)一,看問題的角度不一樣威彰,好時是1+1>2出牧,不好時是1+1<1⌒危「生物軟件」需要做生物的人來開發(fā)舔痕,因為做生物的人才能真正理解做生物的人想要什么,期望怎么用豹缀。當然伯复,我并不是反對交叉,反而我支持交叉邢笙,只是如何交叉啸如,是一個問題。尤其在氮惯,是生物主導開發(fā)為輔叮雳,還是兩者并重,或者生物為輔開發(fā)為主妇汗?這個難以定奪帘不。再換個角度來看,從專業(yè)和領域的熱度來說杨箭,從項目的資助角度來說厌均,生物主導開發(fā)為輔?可能性低告唆,因為開發(fā)往往有更高的熱度拿到更好的項目棺弊。甚至,其實并不需要拿項目擒悬,做開發(fā)的常常是工程化思想模她,考慮的是純粹應用可能性和產品轉化效率。這個本身跟做生物軟件開發(fā)的出發(fā)點不同懂牧,終點也不同侈净。于是問題就會出現(xiàn)尊勿。所以還是要做生物的人自己來開發(fā)生物軟件。而做生物的哪里有時間去折騰這些畜侦?除了一些奇葩的人喜歡做旁門左道不是元扔?
回到主題,
最后旋膳,「生物軟件開發(fā)」是的澎语,就是一把死鎖。很多人都需要一些好用的軟件验懊,但是沒有人愿意去做這些軟件擅羞。在未來很長一段時間,大伙繼續(xù)用斧頭砍樹义图,很難出現(xiàn)電鋸减俏,因為沒有人愿意開發(fā),我們也不愿意碱工,我們還有更重要的事情要去做娃承。那怎么辦?自然是等怕篷,等历筝,等,等到有一天匙头,搞開發(fā)的人發(fā)現(xiàn)漫谷,我把馬達做好了,加上鋸齒片蹂析,是不是就可以拿來“砍樹”舔示?但是,這個是多久以后的事情电抚?誰知道呢惕稻。領域往前走,硬件很重要蝙叛,軟件也很重要俺祠。最后,是自己開了這把鎖借帘,還是別人來鋸開蜘渣?
PS:我還是要補充一下,總有一些人在試圖自己開鎖肺然,與大伙共勉蔫缸!

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