寫(xiě)在前面的一些碎碎念。榜轿。幽歼。。
1.雖然高考去的是理科基地班谬盐，但是讀了幾年博士發(fā)現(xiàn)自己完全不是個(gè)理科生甸私，又被實(shí)驗(yàn)的benchworking折磨了幾年，發(fā)現(xiàn)科學(xué)研究真的是細(xì)節(jié)決定成敗飞傀，機(jī)會(huì)多坑也多皇型。坦率的說(shuō)我是被AI、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的概念糊到生物信息學(xué)這個(gè)方向來(lái)的;前一陣看了清華自動(dòng)化吳軍博士的《數(shù)學(xué)之美》以后砸烦，才覺(jué)得敲擊代碼乃世界上最最銷(xiāo)魂的聲音弃鸦，黑色背景下跳動(dòng)的光標(biāo)乃最性感的文字。加上日常的工作涉及到的數(shù)據(jù)處理幢痘，都是利用試劑公司提供的軟件包或一站式服務(wù)唬格，而作為職場(chǎng)fresh就是那么愛(ài)折騰，想搞清楚后臺(tái)的運(yùn)作颜说；再然后就是因?yàn)橐惨獣x升職稱(chēng)呀（人在屋檐下不得不低頭的那種购岗，沒(méi)文章怎么行？數(shù)據(jù)挖掘或許能做一點(diǎn)有意思的小工作吧门粪。
2.在關(guān)注到j(luò)immy大神的生信技能樹(shù)這個(gè)優(yōu)質(zhì)ip資源之前喊积，我一個(gè)畢業(yè)的生物博士是跟著幾個(gè)熱情爆滿的學(xué)弟學(xué)妹上過(guò)偏實(shí)用的數(shù)據(jù)挖掘課程，因?yàn)槲冶旧淼纳飳W(xué)背景和基礎(chǔ)比較扎實(shí)玄妈，對(duì)于那些課程的上手還比較快乾吻。也于是就很清楚的知道當(dāng)時(shí)文章補(bǔ)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)髓梅，公司是怎么一個(gè)套路分析出來(lái)的? 而國(guó)內(nèi)近幾年大神的文章(CXT BXW et.al)，又是怎么從RNA-seq+IP-MS+CHIP-seq溶弟，或者是scRNA-seq+ATAC-seq中獲得實(shí)驗(yàn)線索和最大創(chuàng)新點(diǎn)的女淑。事實(shí)上我對(duì)那些代碼的感觸就是即學(xué)即用：根據(jù)課題背景選擇幾個(gè)geo,rna-seq數(shù)據(jù)集編號(hào)瞭郑，看一下對(duì)應(yīng)的分組辜御，選擇幾個(gè)常規(guī)的數(shù)據(jù)差異分析套路，R語(yǔ)言跑的飛起屈张∏苋ǎ可是呢，那些代碼還是冰冷的阁谆。這感覺(jué)就是像大師兄帶著你告訴要做哪些實(shí)驗(yàn)碳抄，但是你還是不會(huì)自己設(shè)計(jì)課題。
3.后來(lái)和同樣喜歡研究R的朋友交樓(有些還不止是生物領(lǐng)域)才知道自學(xué)的人都是高度自律的场绿，再看看jimmy的堅(jiān)持剖效，讓我想起不知道是不是比爾蓋茨說(shuō)的一句：“我們往往會(huì)高估自己一年的變化，卻低估自己堅(jiān)持十年的成就”焰盗。然后在閑話的末尾立個(gè)flag吧～以后可以和做實(shí)驗(yàn)生物學(xué)的人比生信水平璧尸，和做生信的人比我的實(shí)驗(yàn)水平（感覺(jué)我的前面的話已經(jīng)超過(guò)了”簡(jiǎn)書(shū)“主旨，好吧我就是那種傳說(shuō)中的無(wú)志者常立志的人）
今天正事就少說(shuō)點(diǎn)熬拒，還得先把遺傳代謝的文章寫(xiě)了爷光。
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在這篇中有對(duì)R初級(jí)應(yīng)用環(huán)境的模型總結(jié)并設(shè)置了相應(yīng)的小作業(yè)R語(yǔ)言練習(xí)題-初級(jí) | 生信菜鳥(niǎo)團(tuán) ，目的是為了對(duì)基本的R元素和數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的概念進(jìn)行梳理GitHub - jmzeng1314/R_bilibili這里有相應(yīng)的答案澎粟，雖然思路很多蛀序，不過(guò)我覺(jué)得真正bible在這里啊～就像我們學(xué)單詞從頭掌握發(fā)音拼寫(xiě)，我覺(jué)得basic-r,basic-R 就是很好的積木活烙，搭建了房屋的結(jié)構(gòu)(如下圖）徐裸。
其余的可以慢慢的參照理解和練習(xí)
但是為了更好地理解計(jì)算機(jī)語(yǔ)言的邏輯，或者說(shuō)對(duì)數(shù)據(jù)的本質(zhì)有一定的邏輯認(rèn)識(shí)啸盏，還是應(yīng)該在Linux框架上進(jìn)行腳本的撰寫(xiě)和分析倦逐，今天就被老師講的sed,awk搞得有點(diǎn)懵，然后在mac和win版中切換的時(shí)候還出現(xiàn)了bug ,導(dǎo)致稀里糊涂的把編輯語(yǔ)言vim下的bashrc默認(rèn)內(nèi)容篡改了宫补，然后在非嚴(yán)格模式下思緒飄走了好一陣檬姥，不過(guò)好在最后將miniconda的時(shí)候又給拽回來(lái)了。
趕緊把小助手老師教我的方式復(fù)盤(pán)在這：造成上述現(xiàn)象的原因是由于錯(cuò)誤的編輯粉怕，導(dǎo)致了swp文件的產(chǎn)生首先選擇E（edit anyway),然后會(huì)出現(xiàn)下面的圖片
依次往下看了一下也沒(méi)有看到明顯的錯(cuò)誤健民，加上了調(diào)整為vim模式的操作方法，insert=i,也沒(méi)有發(fā)現(xiàn)哪里有大的問(wèn)題贫贝，主要看下“psi"那段文字在不在秉犹？（見(jiàn)下圖高量部分）
到這里重點(diǎn)來(lái)了蛉谜，為啥還是會(huì)報(bào)錯(cuò)呢？按esc,再加：wq,推出后激活bashrc（source .bashrc)發(fā)現(xiàn)問(wèn)題還是存在崇堵，但是有了提示型诚？
原來(lái)錯(cuò)誤在第121行多了一個(gè)“；”鸳劳，再次回到vim編輯模式狰贯，把多的刪掉，再重復(fù)執(zhí)行上面的source模式赏廓，發(fā)現(xiàn)問(wèn)題沒(méi)有了涵紊，同時(shí)在進(jìn)入vim模式時(shí)候刪掉bashrc.swp文件選擇D即可。
