Docker:Python環(huán)境Docker鏡像瘦身

關(guān)鍵字:Docker挨厚,Python

原始鏡像

封裝一個Python 3.7的環(huán)境并且安裝Python依賴包實現(xiàn)一個機器學(xué)習(xí)算法預(yù)測任務(wù)次兆,Dockerfile如下

FROM python:3.7
MAINTAINER xxx
ENV PIPURL "https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/"
COPY ./requirements.txt /home
WORKDIR /home
RUN pip install -i ${PIPURL} --default-timeout=1000 -r requirements.txt

requirements.txt如下

jieba==0.40
numpy==1.18.0
pymongo==3.1.1
PyMySQL==0.10.0
pysolr==3.8.1
PyYAML==5.3.1
scikit-learn==0.22.2.post1
scipy==1.4.1
xgboost==1.0.2

構(gòu)建鏡像

$ docker build -t test/test:v1 .

查看鏡像大小有1.58個G

$ docker images                                                                                      
REPOSITORY                  TAG       IMAGE ID       CREATED         SIZE                                                                                     
test/test                   v1        17b88b5e4b7f   2 minutes ago   1.58GB

大在哪里排查

docker history可以查看鏡像構(gòu)建的過程嗤瞎,使用格式化查看并且對Size進行倒序查看

$ docker history --format "{{.Size}} {{.CreatedBy}}" -H=false 17b88b5e4b7f | sort -t ' ' -k 1 -n -r
672415434 RUN /bin/sh -c pip install -i ${PIPURL} --de…
528779103 /bin/sh -c set -ex;  apt-get update;  apt-ge…
151980558 /bin/sh -c apt-get update && apt-get install…
124119398 /bin/sh -c #(nop) ADD file:513c5d5e501279c21…
41623591 /bin/sh -c set -eux;   wget -O python.tar.xz…
18952123 /bin/sh -c set -ex;  if ! command -v gpg > /…
18484074 /bin/sh -c set -eux;  apt-get update;  apt-g…
10699182 /bin/sh -c set -eux;  apt-get update;  apt-g…
10173436 /bin/sh -c set -eux;   wget -O get-pip.py "$…
141 COPY ./requirements.txt /home # buildkit
32 /bin/sh -c set -eux;  for src in idle3 pydoc…
0 WORKDIR /home
0 MAINTAINER xxx
0 ENV PIPURL=https://mirrors.aliyun.com/pypi/s…
0 /bin/sh -c #(nop)  ENV PYTHON_VERSION=3.7.16
0 /bin/sh -c #(nop)  ENV PYTHON_SETUPTOOLS_VER…
0 /bin/sh -c #(nop)  ENV PYTHON_PIP_VERSION=22…
0 /bin/sh -c #(nop)  ENV PYTHON_GET_PIP_URL=ht…
0 /bin/sh -c #(nop)  ENV PYTHON_GET_PIP_SHA256…
0 /bin/sh -c #(nop)  ENV PATH=/usr/local/bin:/…
0 /bin/sh -c #(nop)  ENV LANG=C.UTF-8
0 /bin/sh -c #(nop)  ENV GPG_KEY=0D96DF4D4110E…
0 /bin/sh -c #(nop)  CMD ["python3"]
0 /bin/sh -c #(nop)  CMD ["bash"]

其中--format "{{.Size}} {{.CreatedBy}}"是使用GO的模板只輸出Size和CreatedBy兩列必逆,-H關(guān)閉將Size的單位去除捷犹,sort -t ' ' -k 1 -n -r表示根據(jù)空格分割后以第一列作為數(shù)值倒序排列耐床。從結(jié)果來看CMD岭接,ENV富拗,WORKDIR臼予,MAINTAINER這些操作都沒有大小,只有COPY啃沪,RUN以及其他環(huán)境準(zhǔn)備的執(zhí)行命令造成了鏡像體積變大粘拾。

(1)pip install依賴包

共計672MB,進入鏡像

$ docker run -it e602098faafe /bin/bash

pip 安裝的依賴都在/usr/local/lib/python3.7/site-packages下查看各個包占用大小

root@241937acc2aa:/usr/local/lib/python3.7/site-packages# du -s ./* |sort -nr
204416  ./xgboost
92252   ./scipy
80728   ./numpy
43164   ./jieba
29644   ./sklearn
13012   ./pip
2964    ./setuptools
2088    ./joblib
1652    ./_yaml.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so
1224    ./pymongo
...

加起來大概466MB创千,還差206MB不知道被什么占用了缰雇,另外從依賴包來看xgboost比較大200m,scipy和numpy比較大加起來也差不多200m

(2)安裝一系列autoconf automake bzip2 dpkg-dev file g++ gcc imagemagick libbz2-dev libc6-dev libcurl4-openssl-dev libdb-dev libevent-dev libffi-dev libgdbm-dev libglib2.0-dev libgmp-dev libjpeg-dev libkrb5-dev liblzma-dev libmagickcore-dev libmagickwand-dev libmaxminddb-dev libncurses5-dev libncursesw5-dev libpng-dev libpq-dev libreadline-dev libsqlite3-dev libssl-dev libtool libwebp-dev libxml2-dev libxslt-dev libyaml-dev make patch unzip xz-utils zlib1g-dev..

共計500m追驴,不知道是怎么進來的械哟,可能有些有用有些沒用

(3)安裝一系列g(shù)it mercurial openssh-client subversion procps ...

共計150m,不知道是怎么進來的殿雪,這些版本控制的東西對我應(yīng)用沒啥用

(4)ADD file:513c5d5e501279c21a05c1d8b66e5f0b02ee4b27f0b928706d92fd9ce11c1be6

共計120m暇咆,是第一層鏡像源


瘦身策略

(1)不產(chǎn)生pip緩存文件或者刪除pip緩存文件

pip install占用空間比site-package下的實際空間大出200MB,懷疑是.cache/pip下的pip緩存文件導(dǎo)致丙曙,該文件有199MB

root@ea2784eace4d:~/.cache# du -sh pip/
199M    pip/

在pip時使用--no-cache-dir不使用緩存糯崎,改變以下Dockerfile代碼

RUN pip install --no-cache-dir -i ${PIPURL} --default-timeout=1000 -r requirements.txt

重新構(gòu)建之后鏡像大小下降到1.37GB下降大概200MB

$ docker images                                                                                                                                                                      
REPOSITORY   TAG       IMAGE ID       CREATED             SIZE                                                                                                                                                                                
test/test    v4        32a596269bf0   39 seconds ago      1.37GB

再進入容器發(fā)現(xiàn)已經(jīng)沒有~/.cache/pip文件夾

$ docker run -it 32a596269bf0 /bin/bash
root@f1526275c8af:/home# cd
root@f1526275c8af:~# cd .cache
(2)Python源瘦身

docker:3.7在倉庫中的版本有

python       3.7-slim     22bf9d1adb34   3 days ago       123MB
python       3.7-alpine   807a8b5dd4df   6 days ago       46.9MB
python       3.7-buster   98c2e7c177c7   6 days ago       879MB
python       3.7          4d9a42ad20a7   6 days ago       905MB

slim: 瘦身版,省略許多不常用的依賴河泳,故而它變得很小沃呢,但是如果需要一些不常用的依賴時,需要自己安裝拆挥,如需體積較小的鏡像時用slim 版本制作薄霜,有一定安裝難度
alpine: 包含了在 Linux 上運行 Python 所需要的最小環(huán)境,它使用 Alpine 作為系統(tǒng)纸兔。因為它最小惰瓜,所以只能直接運行純 Python 代碼。任何需要編譯 C 代碼或動態(tài)鏈接庫的 Python 倉庫都不能直接使用汉矿,需要自己安裝依賴崎坊,需要花費大量時間來安裝系統(tǒng)依賴,收益不大洲拇,最終鏡像的大小與 slim 版本的基本相同
buster: 此類鏡像使用Debian10作為系統(tǒng)奈揍,包含了所有 CPython 所需要的依賴,如果環(huán)境難以安裝選擇buster 鏡像赋续,最終制作完成通常比 slim 大不少
default: 使用Debian的bullseye做為默認(rèn)鏡像基礎(chǔ)系統(tǒng)

下面改為用slim作為源鏡像男翰,修改Dockerfile如下

FROM python:3.7-slim
MAINTAINER xxx
RUN echo 'deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/debian/ bullseye main contrib non-free' > /etc/apt/sources.list && \
    echo 'deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/debian/ bullseye-updates main contrib non-free' >> /etc/apt/sources.list && \
    echo 'deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/debian/ bullseye-backports main contrib non-free' >> /etc/apt/sources.list && \
    apt-get update && \
    apt-get install -y \
    g++ \
    make \
    cmake \
    libcurl4-openssl-dev 
ENV PIPURL "https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/"
COPY ./requirements.txt /home
WORKDIR /home
RUN pip install --no-cache-dir -i ${PIPURL} --default-timeout=1000 -r requirements.txt

手動安裝了g++,make纽乱,cmake等環(huán)境蛾绎,重新構(gòu)建鏡像結(jié)果如下

$ docker images                                                                                      
REPOSITORY   TAG          IMAGE ID       CREATED          SIZE                                                                                                
test/test    v8           7dc43999c361   27 minutes ago   893MB

直接從1.37GB下降到893MB,測試一下里面的py包都可以運行

(3)apt 安裝中使用 --no-install-recommends

apt install 命令來安裝某些包時,它會安裝一些不需要的推薦包租冠,使用--no-install-recommends避免這個情況鹏倘,修改Dockerfile如下

apt-get install -y --no-install-recommends \
    g++ \
    make \
    cmake \
    libcurl4-openssl-dev 

其中-y:yes,在命令行交互提示中顽爹,直接輸入 yes纤泵,新構(gòu)建的鏡像大小如下,從893MB降低到881MB又宰掉12MB

$ docker images                                                                                      
REPOSITORY   TAG          IMAGE ID       CREATED             SIZE                                                                                             
test/test    v9           2192fccb9858   13 minutes ago      881MB
(4)清理apt install緩存

apt-get clean 命令清除遺留在 /var/cache 中的已取回的包文件的本地倉庫话原,rm -rf /var/lib/apt/lists刪除緩存的源信息夕吻,刪除之可以繼續(xù)降低空間占用,修改Dockerfile如下

RUN echo 'deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/debian/ bullseye main contrib non-free' > /etc/apt/sources.list && \
    echo 'deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/debian/ bullseye-updates main contrib non-free' >> /etc/apt/sources.list && \
    echo 'deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/debian/ bullseye-backports main contrib non-free' >> /etc/apt/sources.list && \
    apt-get update && \
    apt-get install -y --no-install-recommends \
    g++ \
    make \
    cmake \
    libcurl4-openssl-dev && \
    apt-get clean && \
    rm -rf /var/lib/apt/lists/*

再次構(gòu)建后查看鏡像的大小繁仁,從881MB降低到862MB涉馅,又再掉19MB

$ docker images                                                                                      
REPOSITORY   TAG          IMAGE ID       CREATED             SIZE                                                                                             
test/test    v10          59e37a627394   43 seconds ago      862MB
(5)多階段構(gòu)建

多個FROM語句,每個FROM指令都可以使用不同的基礎(chǔ)鏡像黄虱,第一階段使用buster作為源稚矿,把依賴包全部安全正確安裝進來,再第二階段以slim作為源捻浦,再把第一階段的僅僅和運行相關(guān)的依賴全部COPY過來

FROM python:3.7-buster as base-image
MAINTAINER xxx
ENV PIPURL "https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/"
COPY ./requirements.txt /home
WORKDIR /home
RUN pip install --no-cache-dir -i ${PIPURL} --default-timeout=1000 -r requirements.txt

FROM python:3.7-slim
COPY --from=base-image /usr/local/bin /usr/local/bin
COPY --from=base-image /usr/bin /usr/bin
COPY --from=base-image /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgomp.so.1 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgomp.so.1
COPY --from=base-image /usr/local/lib/python3.7/site-packages /usr/local/lib/python3.7/site-packages

docker語法:

標(biāo)志 --from=<name> 將從 from 指定的構(gòu)建階段中尋找源文件

重新build之后只有650MB晤揣,和862MB相比繼續(xù)下降212M

$ docker images
REPOSITORY   TAG          IMAGE ID       CREATED             SIZE
test/test    v12          a14124089863   5 minutes ago       650MB
(6)Xgboost瘦身

Xgboost包占用了200MB,網(wǎng)上查到從源碼下載編譯安裝只需要50MB朱灿,但是測試沒有安裝成功昧识,下次再測

(7)其他方法

網(wǎng)上還有其他方法,包括
1.使用 Docker Squash 減小鏡像大小
2.使用 .dockerignore 文件盗扒,將不需要的文件不進入鏡像
3.在 RUN 之后放置 COPY
4.將幾個RUN語句合并在一行中跪楞,這樣可以減少層數(shù)


docker鏡像大小取舍

由于同一臺機器上的 docker Image 是可以共享的,要快速啟動并運行項目侣灶,沒有空間限制甸祭,許多 Python 項目需要跑在同一臺機器上時,default 或 buster 是最好的選擇褥影。如果愿意花時間去調(diào)試依賴并且對鏡像大小有追求時池户,slim 和 alpine 都是好的選擇。

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
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