在傳統(tǒng)分類系統(tǒng)（主要以形態(tài)結(jié)構(gòu)特征為分類依據(jù)）中丛晦，蓮與睡蓮是近親蜀漆，都屬于蓮目。它們的確長得相像铡买，且都生活在水里，有人可能都不能把它們區(qū)分開霎箍。在主要以分子資料為依據(jù)的分類系統(tǒng)中奇钞，如APG系統(tǒng)，蓮科被放到山龍眼目漂坏。蓮與睡蓮長得相像是因?yàn)樗鼈優(yōu)榱诉m應(yīng)相同的生活環(huán)境而發(fā)生了趨同演化景埃。由于趨同演化而形成的相似特征與同源相似特征（繼承自共同祖先的相似特征）很難區(qū)分，這是造成以前植物分類學(xué)家認(rèn)為蓮和睡蓮關(guān)系近的原因樊拓。
有人不能區(qū)分蓮和睡蓮纠亚，在此，根據(jù)個人觀察說說二者的主要形態(tài)差別筋夏。其實(shí)蒂胞，根據(jù)葉形就很容易把蓮和睡蓮區(qū)分開。蓮的葉子是盾形葉条篷，葉片基本正圓骗随，葉柄長在葉片中央。睡蓮的葉常為橢形葉赴叹，且有一個深缺鸿染，葉柄長在缺處。另外乞巧，蓮的葉有挺水葉（葉片挺出水面）涨椒，睡蓮的葉都是浮水葉（浮在水面），無挺水葉绽媒。
蓮花（荷花）與睡蓮的花形雖然基本相似，但蓮花中央有明顯的倒圓錐形的蓮蓬获三，睡蓮的花看不到蓮蓬旁蔼。相比較，蓮的花瓣較寬疙教，睡蓮的相對較窄棺聊。花色方面贞谓，蓮只有白色和紅色和黃色（從美國引入的黃蓮花為黃色）躺屁，睡蓮的花色則豐富得多，紅经宏、藍(lán)犀暑、紫驯击、黃、粉等顏色都有耐亏。
蓮的根狀莖-蓮藕和種子蓮子都是非常好的補(bǔ)益類食品徊都。睡蓮主要用來觀賞，食用的非常少广辰。中科院西雙版納植物園現(xiàn)在開發(fā)出睡蓮花茶暇矫，還沒有品嘗過，應(yīng)該是很不錯的色香味形皆美的花茶择吊。西雙版納植物園的育種專家吳福川培育出的“粉月亮”和“藍(lán)鳥啼血”睡蓮品種分別于2017年和2018年獲得國際登錄注冊證書李根。
