背景：Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) is a computational method that determines whether an a priori defined set of genes shows statistically significant, concordant differences between two biological states 闷营。（官網(wǎng)下載需填郵箱）
網(wǎng)址：http://software.broadinstitute.org/gsea/index.jsp
遇到問題: (集中在Java版本）1. GSEA運(yùn)行需要Java； 2. 電腦自帶Java,打不開GSEA
發(fā)現(xiàn)問題:?GSEA支持java 版本(java 8)與電腦Java版本（java 11.0.1）不匹配。(在下載的時候有提示java版本籍琳，沒看說明導(dǎo)致７蒲纭！趋急！)
解決問題：
1. ##查看電腦 java 版本
java -version
2.我選擇用conda安裝java 8
## 根據(jù)你自己的電腦來選擇性安裝conda
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
# 然后修改鏡像喝峦，加快下載速度
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
##安裝
sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
## 把java8安裝到指定環(huán)境，隔離開來
conda create -n qc
source activate qc
conda install openjdk=8.0.152
##版本成功呜达，查看java版本
java -version
##運(yùn)行：
java -jar gsea-3.0.jar
##很多broad institute出品的軟件都依賴于 java8
## 想了解版本谣蠢，
conda search openjdk
Loading channels: done
# Name? ? ? ? ? ? ? ? ? Version? ? ? ? ? Build? Channel? ? ? ? ?
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 7.0.161? zulu7.21.0.3_0? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.112? zulu8.19.0.1_0? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.112? zulu8.19.0.1_1? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.112? zulu8.19.0.1_2? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.112? zulu8.19.0.1_3? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.121? ? ? ? ? ? ? 0? pkgs/free? ? ? ?
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.121? ? ? ? ? ? ? 1? pkgs/free? ? ? ?
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.121? zulu8.20.0.5_0? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.144? zulu8.23.0.3_0? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.144? zulu8.23.0.3_1? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.144? zulu8.23.0.3_2? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.152? ? ? h393ad39_1? pkgs/main? ? ? ?
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.152? ? ? he2ab291_0? pkgs/main? ? ? ?
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? 8.0.192? ? ? h470a237_2? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 9.0.7? ? h470a237_14? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 9.0.7? ? h470a237_15? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 9.0.7? ? ? h470a237_2? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 9.0.7? ? ? h470a237_3? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 9.0.7? ? ? h470a237_4? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 9.0.7? zulu9.0.7.1_0? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 10.0.2? ? h470a237_14? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 10.0.2? ? h470a237_15? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 10.0.2? ? ? h470a237_2? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 10.0.2? ? ? h470a237_3? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 10.0.2? ? zulu10.3+5_0? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 11.0.1? ? h470a237_10? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 11.0.1? ? h470a237_11? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 11.0.1? ? h470a237_13? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 11.0.1? ? h470a237_14? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 11.0.1? ? ? h470a237_2? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 11.0.1? ? ? h470a237_3? anaconda/cloud/conda-forge
openjdk? ? ? ? ? ? ? ? ? 11.0.1? ? zulu11.2.3_0? anaconda/cloud/conda-forge
感謝：Jimmy 以及生信技能樹
