同源序列（homologous sequences）
同源序列指兩個序列具有共同的祖先森爽。同源性（homology）是一個定性的概念触幼，我們說兩條序列是或不是同源基因。但是同源序列可以用相似性（similarity）來度量化撕。注意譬正，同一性（identity）指兩條序列完全相同。
同源序列又可分為直系同源（ortholog）和旁系同源（paralog）盛撑。直系同源指來自不同物種的同一基因碎节，基因序列相似，被認為源自一個共同祖先物種的單一基因抵卫。它們的形成是由于物種形成（speiciation event）狮荔，往往具有相似的功能。旁系同源則是在基因復(fù)制過程中（gene duplication event）產(chǎn)生的介粘，往往不具有相似的功能殖氏。
直系同源與旁系同源。（圖片來源網(wǎng)絡(luò)姻采，侵刪雅采。）
基因復(fù)制（gene duplication）
由上圖我們可以看出，基因復(fù)制可以產(chǎn)生直系同源基因和旁系同源基因慨亲。直系同源婚瓜，指兩條序列來自復(fù)制序列的相同拷貝；而旁系同源刑棵，則指兩條序列來自復(fù)制基因的不同拷貝巴刻。但所有這些由同一個基因復(fù)制產(chǎn)生的子基因，即使具有不同功能铐望，也都屬于同一個基因家族（gene family）冈涧。
要點歸納
1. 注意同源性和相似性的區(qū)別。相似性是一種度量屬性正蛙，而同源性是基因背景的屬性督弓。同源基因在序列上是相似的，但相似的序列不一定是同源的乒验。
2. 基因家族包括直系同源基因和旁系同源基因愚隧。
思考
相似度多少可以被認作是同源基因？（用核苷酸和氨基酸的度量標準一樣嗎锻全？）
